UGT1A1

Genvarianter inkludert i analysen

Genvariantene som analyseres for er antall TA-enheter.

Seks repeterende TA-enheter (TA6). Dette er den vanligste varianten hos nordeuropeere og gir normal enzymaktivitet. Økning av de repeterende enheter til (TA7) eller (TA8) fører til en betydelig redusert enzymaktivitet, mens en reduksjon til (TA5) øker enzymaktiviteten.

UGT1A1 (TA)5/6/7/8: LRG_733:g.4963TA (rs8175347)

Analysen utføres ved Avd. for medisinsk biokjemi, Ullevål.

Avdeling for farmakologi, Rikshospitalet, har medisinskfaglig ansvar for analysene og er ansvarlig for tolkning og rapportering av analysesvar.

Prøvemateriale

EDTA-fullblod, volum: 1 mL

Prøvetakingstidspunkt

Ingen restriksjoner

Oppbevaring

Prøven er holdbar flere døgn i romtemperatur, men oppbevaring i kjøleskap anbefales. Ved lengre tids lagring ( >1 mnd) bør prøven fryses.

Forsendelse

Ordinær post, kan sendes i romtemperatur.

Svartid

Svar foreligger vanligvis innen 2 uker, ta kontakt dersom det haster mer.

Analysemetode

Pyrosekvensering vha PyroMark Q24 (Qiagen) instrument.

NLK-kode

NPU2799

Forekomsten av UGT1A1-genvarianter er forskjellig mellom ulike folkegrupper.

Frekvens av UGT1A1-genvarianter (allelfrekvens)

• (TA) 6: ca 60% blant nordeuropeere, 50% hos afrikanere og 90% hos asiatere
• (TA) 7: ca 35% blant nordeuropeere, 35% hos afrikanere og < 1% hos asiatere
• (TA) 8: ca 0-1% blant nordeuropeere og asiatere, 10% hos afrikanere
• (TA) 5: ca 0-1% blant nordeuropeere og asiatere, 5% hos afrikanere

Indikasjon

Sekvensvariasjon i UGT1A1-genets regulerende område kan føre til både redusert og økt enzymmengde, med påfølgende varierende glukuronideringskapasitet. Indikasjon for analysen er å påvise eller utelukke UGT1A1-varianter med betydning for dosering av irinotekan. Genotyping av UGT1A1 kan også bidra til å forklare årsaken til økte bilirubinverdier.

Aktuelle legemidler

Kommentar

Pasientens genotype er i utgangspunktet stabil og uendret gjennom hele livet. Det er således normalt ikke indisert å gjenta en genotyping hvis den er utført tidligere og svaret er tilgjengelig for rapportering. Unntak kan være:

• Ønske om ny genotyping med en mer omfattende metode: Hvis man tidligere bare har fått undersøkt én eller noen få DNA-sekvensvarianter i det aktuelle genet, kan det være aktuelt å teste på igjen med en ny eller mer omfattende metode som fanger opp flere varianter.
• Pasienten er transplantert: Stamcelletransplantasjon tilfører donorleukocytter, noe som vil gi endret genotype ved analysering av blodprøve. Organtransplantasjon tilfører organ med donors genotype. Blodceller og øvrige vev er da uendret.
• Mistanke om feil: Selv om det er sjelden, kan det forekomme berettiget mistanke om feil analyseresultat. I så fall kan ny genotyping være indisert. I tillegg til prøveforbytning eller feil knyttet til analysering eller rapportering, kan det ved leukopeni i forbindelse med graviditet eller hos personer som får ordinær blodoverføring (én enhet SAG-blod kan inneholde inntil 1 million leukocytter) forekomme at det i en periode på inntil noen måneder blir en tilblanding og proliferasjon av fosters eller blodgivers leukocytter (mikrokimerisme) som kan gi endret genotyperesultat.
• Klonal ekspansjon av mutert cellelinje hos pasienten.

CYPinfo

CYPinfo er et beslutningsstøttende verktøy til hjelp for leger som rekvirerer farmakogenetiske analyser. Tjenesten er web-basert og fritt tilgjengelig på http://www.cypinfo.no/. For å bruke CYPinfo må du ha et farmakogenetisk prøvesvar. Verktøyet viser hvordan den enkelte pasients genvarianter påvirker behandling med ulike legemidler. Påviste genvarianter kobles opp mot enkeltlegemidler eller en legemiddelgruppe. Det genereres en rapport som gir en oversikt over hvordan pasientens genetikk kan påvirke effekten av aktuelle legemidler og det gis forslag til hvordan behandlingen kan tilpasses for å veie opp for dette.

Vakttelefon (klinisk farmakolog, farmasøyt): 941 33 218 (hverdager kl 08.30-14.30). Vakttelefonen betjener spørsmål fra rekvirerende lege (ikke pasienter).

• Se avdelingens hjemmeside