BRAF

BRAF variantanalyse av cytologisk materiale fra knuter i thyreoidea

Seksjon for Molekylærgenetisk diagnostikk tilbyr i samarbeid med Patologi- og Bryst- og Endokrinkirurgisk avdeling variantanalyse* for BRAF-genet (B-type Raf kinase) i cytologisk materiale fra thyroidea. BRAF er et gen som koder for proto-onkogenet B-Raf og er en av hovedkomponentene i MAP-kinase signaltransduksjonsveien (MAPK: mitogen-activated protein kinase).

Endringer i BRAF-genet er forbundet med ulike kreftformer og er den mest vanlige genetiske endringen observert ved sporadisk PTC (papillary thyroid cancer). BRAF V600E-variasjon forekommer i omtrent 45% av sporadiske PTC. Analysen kan brukes som en diagnostisk markør og øker spesifisiteten i den morfologiske cytologidiagnostikken. Variasjonen V600E skjer i form av en basesubstitusjon i posisjon 1799 hvor nukleotid thymin (T) blir erstattet med adenin (A), T1799A. Dette resulterer i at aminosyren valin i posisjon 600 blir erstattet med glutaminsyre (V600E mutasjon).

Svulster som har BRAF-variasjon er med høy sannsynlighet maligne selv om de morfologiske funnene ikke er diagnostiske. Dette gir bedre prioritering av pasienter med sannsynlig malign tumor i thyroidea til operasjon.

Prøvemateriale og prøvetaking:

Prøvetaking gjøres med ultralydveiledet finnålspunksjon og prøvematerialet overføres til beholder med Cytolyt preserveringsløsning (metanolbasert).

Holdbarhet:

Celler oppbevart i Cytolyt har lang holdbarhet.

Svartid:

5 virkedager fra prøven mottas ved Molekylærgenetisk diagnsotikk, TLMB.

Gen som undersøkes:

Homo sapiens B-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinase (BRAF), mRNA LRG_299

Metode:

Real-time PCR med Qiagen therascreen® BRAF RGQ PCR Kit. Metoden kan detektere ned til 5% variantsekvenser i en bakgrunn av villtype genomisk DNA.

Oversikt over varianter som påvises med therascreen® BRAF RGQ PCR Kit, se tabell 1: