Mistanke om infeksjon med muggsopp.
Ekspektorat, Indusert sputum, Trachealsekret, Bronkial skyllevæske, Sinussekret, Biopsimateriale, , Spinalvæske, andre Sterile væsker mm avhengig av problemstilling.
Lokale variasjoner kan forekomme.
Som for vanlig bakteriologisk undersøkelse, men penselprøver er mindre egnet enn vevsprøver for å påvise muggsoppinfeksjon i vev.
Dyrkning på selektive medier.
Gode kliniske opplysninger kan hjelpe laboratoriet til å tolke funn ved besvarelse.
Muggsopp kan kontaminere prøvematerialet, være uttrykk for kolonisering av pasienten (eks luftveier) og forårsake alvorlig sykdom. Funn av muggsopp må relateres til pasientens risikofaktorer og samholdes med klinikk og annen utredning.