Dermatofytt DNA
Indikasjon for prøvetaking
Forandringer i negl, hud eller hår der det er mistanke om dermatofytt-infeksjon.
Prøvemateriale
Hudavskrap, neglavskrap, neglbiter eller hår.
Rekvirering
Elektronisk rekvirering anbefales.
Rekvirenter uten slik tilgang, se Rekvisisjoner
Prøvetaking og behandling
Se Hudavskrap, Neglprøver og Hårprøver.
Oppbevaring og forsendelse
Oppbevares i romtemperatur
Undersøkelsesprinsipp
Sanntids polymerasekjedereaksjon (PCR) for påvisning av dermatofytter.
Prøver til Dermatofytt-DNA analyseres med følgende analyser
- Spesifikk Trichophyton PCR som inneholder følgende analyser:
- US-T. rubrum kompleks DNA
- US-T. mentagrophytes kompleks DNA
- US-T. tonsurans DNA
- US-T. schoenleinii DNA
- US-T. violaceum DNA
- Positive prøver analyseres med US-Trichophyton sp. DNA (Terbinafinresistens)
- Påviser mutasjoner i SQLE genet.
- Dersom spesifikk PCR er negativ utføres US-Pan dermatofytt-PCR
- Påviser sjeldnere forekommende Trichophyton spp., Microsporum spp. og Epidermophyton spp. Påvisning til artsnivå og genetisk terbinafinresistens er da ikke mulig.
Utførende laboratorium
Enhet for Bakteriologi, OUS Rikshospitalet.
Svar
Spesifikk og pan dermatofytt -PCR: Påvist/ikke påvist
Eventuelt med en kommentar
Terbinafin resistens-PCR: Påvist/ikke påvist
Svartid
Ca. 7 dager.
Tolkning
Spesifikk Trichophyton PCR;
Metoden er ikke egnet for å skille mellom ulike arter innen artskompleksene og heller ikke alltid mellom andre nært beslektede arter
- US-T. rubrum kompleks DNA:
- Metoden kan ikke skille mellom T. rubrum og T. soudanense, men sistnevnte forårsaker kun tinea capitis og forekommer i Norge som importsmitte, hovedsakelig fra Afrika.
- US-T. mentagrophytes kompleks DNA:
- Vanligst er artene T. mentagrophytes, T. interdigitale og T. indontineae.
- Metoden kan påviseT. mentagrophytes (ITS type IV) men dessverre IKKE T. indontineae T. mentagrophytes (ITS type VIII)
- Funn av terbinafinresistens hos T. mentagrohytes kompleks taler for funn av T. indotineae.
- US-T. schoenleinii DNA
- Metoden skiller ikke mellom T. schoenleinii og T. quinceanum
- US-T. tonsurans DNA
- US-T. violaceum DNA
- Eventuell terapisvikt er vanligvis ikke forårsaket av terbinafinresistens
Us-Trichophyton sp. DNA (Terbinafinresistens)
- Kan bare analyseres der spesifikt Trichophyton DNA er påvist. I noen tilfeller har en for lite arvemateriale til at resistensanalyse er mulig og resistens-PCR svares som inkonklusiv.
Us-Dermatofytt DNA analyseres dersom Trichophyton DNA ikke påvises med metoden over. Aktuell slekt besvares som kommentar til analyse:
- Best forenlig med Trichophyton sp DNA fra arter som ikke inngår i spesifikk PCR analyse
- Best forenlig med Epidermophyton floccosum DNA
- Best forenlig med Microsporum sp. DNA
Nærmere artsidentifikasjon og påvisning av terbinafinresistens er ikke mulig når dermatofytt DNA påvises med denne pan-dermatofytt DNA påvisningen.
Merknader
Ved sterk mistanke om dermatofyttinfeksjon hos en pasient med negativ PCR, kan det være aktuelt å dyrke prøven i tillegg til PCR-undersøkelse.
Dette gjelder spesielt der det er mistanke om T. violaceum (i avskrap fra hodebunn hos barn), men prøver fra andre pasienter med hodebunnssopp (tinea capitis) bør også dyrkes parallellt med PCR.
Ved utbredt infeksjon, utbrudd, smitte fra dyr, alvorlig og utbredt dermatofyttinfeksjon og mistanke om terapisvikt bør dermatofyttdyrkning vurderes.
Trichophyton indotineae påvises som T. mentagrophytes kompleks DNA.
Akkreditert
Analysen er akkreditert.
Vi kan ikke love deg svar på tilbakemeldingen din, men bruker den til å forbedre innholdet. Vi ber om at du ikke deler person- eller helseopplysninger.
