Molekylære analyser, solide svulster
BRAF
Viktig informasjon
- Denne testen utføres med IdyllaTM NRAS-BRAF Mutation Test fra Biocartis og påviser kun følgende varianter i BRAF : V600E/D, V600K/R.
- Dersom BRAF er rekvirert sammen med KRAS, vil det først analyseres for varianter i KRAS.
- Hvis positiv for variant i KRAS, vil det ikke gjøres videre analyse av BRAF.
- BRAF kan også inngå i en analysepakke på HTS som vil kunne påvise ytterligere varianter.
Prøvemateriale
Formalinfiksert, parafininnstøpt (FFPE) vev.
Patologilaboratoriene behøver ikke å sende fra seg parafinblokker. DNA isoleres fra snitt montert på objektglass. Innsendt snitt vil ikke bli returnert.
HE-farget snitt + 4 stk. 10μm ufargede snitt montert på objektglass (evt. blokk, dersom det ikke er mulighet for å lage snitt). Minimum 10% neoplastiske celler.
Forventet svartid
Forventet svartid er innen 7 virkedager.
Undersøkelsesprinsipp
Idylla™ NRAS-BRAF Mutation Test er en fullautomatisert, multipleks PCR-test som utføres på Biocartis Idylla™-systemet.
Svar
Resultatet rapporteres som:
- Variant påvist (med beskrivelse av hvilken variant som ble påvist).
- Variant ikke påvist
- Inkonklusiv.
Tolkning
IdyllaTM NRAS-BRAF mutation test fra Biocartis kombinerer analyse av NRAS og BRAF V600.
En internkontroll tester for mengde amplifiserbart DNA i prøven. Idylla programvare tolker signalene fra PCR-reaksjonen i internkontrollen og pasientprøven og avgjør genotype ved å beregne forskjellen mellom BRAF-kontrollens Cq og Cq som ble oppnådd variantsignaler.
Måleusikkerhet
- Metoden er validert med FFPE fra vev med opphav fra kolorektal tumor.
- Bruk av prøver som ikke oppfyller kriterier for mengde vev, amplifiserbart DNA eller andel neoplastiske celler kan medføre upålitelig eller ugyldig resultat.
- Idylla™ NRAS-BRAF Mutation Test kan påvise allelefrekvenser ≥ 5 % i BRAF-genet i kodon 600.
- Variantene V600fs*11 (c.1799_1800delTG) og V600Q (c.1798_1799delinsCA) kan påvises og rapporteres som V600E/D eller V600K/R.
