BRAF

Sist oppdatert: 04.02.2024
Forfattere: Geir Kongelf, Eva Smedsrud
Utgiver: Oslo universitetssykehus
Godkjent av: Mohsen Shadidi
Godkjent dato: 01.09.2023
Versjon: 1.2
For tilgang til tidligere versjoner, kontakt redaktøren.
Kopier lenke til dette emnet
Foreslå endringer/gi kommentarer

Viktig informasjon 

  • Denne testen utføres med IdyllaTM NRAS-BRAF Mutation Test fra Biocartis og påviser kun følgende varianter i BRAF : V600E/D, V600K/R.
  • Dersom BRAF er rekvirert sammen med KRAS, vil det først analyseres for varianter i KRAS.
  • Hvis positiv for variant i KRAS, vil det ikke gjøres videre analyse av BRAF.
  • BRAF kan også inngå i en analysepakke på HTS som vil kunne påvise ytterligere varianter.

Prøvemateriale 

Formalinfiksert, parafininnstøpt (FFPE) vev.

Patologilaboratoriene behøver ikke å sende fra seg parafinblokker. DNA isoleres fra snitt montert på objektglass. Innsendt snitt vil ikke bli returnert.

 

HE-farget snitt + 4 stk. 10μm ufargede snitt montert på objektglass (evt. blokk, dersom det ikke er mulighet for å lage snitt). Minimum 10% neoplastiske celler.

Forventet svartid 

Forventet svartid er innen 7 virkedager.

Undersøkelsesprinsipp 

Idylla™ NRAS-BRAF Mutation Test er en fullautomatisert, multipleks PCR-test som utføres på Biocartis Idylla™-systemet.

Svar 

Resultatet rapporteres som:

  • Variant påvist (med beskrivelse av hvilken variant som ble påvist).
  • Variant ikke påvist
  • Inkonklusiv.

Tolkning 

IdyllaTM NRAS-BRAF mutation test fra Biocartis kombinerer analyse av NRAS og BRAF V600.

En internkontroll tester for mengde amplifiserbart DNA i prøven. Idylla programvare tolker signalene fra PCR-reaksjonen i internkontrollen og pasientprøven og avgjør genotype ved å beregne forskjellen mellom BRAF-kontrollens Cq og Cq som ble oppnådd variantsignaler.

Måleusikkerhet 

  • Metoden er validert med FFPE fra vev med opphav fra kolorektal tumor.
  • Bruk av prøver som ikke oppfyller kriterier for mengde vev, amplifiserbart DNA eller andel neoplastiske celler kan medføre upålitelig eller ugyldig resultat.
  • Idylla™ NRAS-BRAF Mutation Test kan påvise allelefrekvenser ≥ 5 % i BRAF-genet i kodon 600.
  • Variantene V600fs*11 (c.1799_1800delTG) og V600Q (c.1798_1799delinsCA) kan påvises og rapporteres som V600E/D eller V600K/R.

Fant du det du lette etter?
Ja
Nei
Så bra. Fortell oss gjerne hva du var fornøyd med.
Vi kan ikke love deg svar på tilbakemeldingen din, men bruker den til å forbedre innholdet. Vi ber om at du ikke deler person- eller helseopplysninger.
Send
Kan du fortelle oss hva du var ute etter?
Vi kan ikke love deg svar deg på tilbakemeldingen din, men bruker den til å forbedre innholdet. Vi ber om at du ikke deler person- eller helseopplysninger.
Send