Formalinfiksert, parafininnstøpt (FFPE) vev.
Forventet svartid er innen 15 virkedager.
Det benyttes ION Torrent 'neste-generasjons sekvensering' fra Thermo Fisher. Dette er en massiv parallell sekvensering med flere millioner samtidige sekvenseringsreaksjoner.
Påviste fusjonstranskripter som involverer NTRK1/2/3 angis med 5'-donor og 3'-akseptor med gjeldende ekson-bruddpunkt.
Påviste fusjonstranskripter som passerer kvalitetsparametere vil rapporteres.
Panelet er målrettet og vil ikke inkludere alle mulige varianter. For fusjonstranskripter kan sjeldent forekommende fusjonspartnere eller bruddpunkt medføre negativt resultat.
Materiale av redusert kvalitet (lav konsentrasjon, fragmentert, deaminert) kan gi redusert sensitivitet.