Patologi (OUS)Analyser patologiMolekylære analyser av solide svulsterMolekylære analyser, solide svulsterNTRK1/2/3
Analyser som begynner på ...
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
Æ
Ø
Å
Molekylære analyser, solide svulster
NTRK1/2/3
04.02.2024•Versjon 1.2•Godkjent av: Mohsen Shadidi•Godkjent dato: 2023-09-01
Prøvemateriale
Formalinfiksert, parafininnstøpt (FFPE) vev.
Forventet svartid
Forventet svartid er innen 15 virkedager.
Undersøkelsesprinsipp
Det benyttes ION Torrent 'neste-generasjons sekvensering' fra Thermo Fisher. Dette er en massiv parallell sekvensering med flere millioner samtidige sekvenseringsreaksjoner.
Svar
Påviste fusjonstranskripter som involverer NTRK1/2/3 angis med 5'-donor og 3'-akseptor med gjeldende ekson-bruddpunkt.
Tolkning
Påviste fusjonstranskripter som passerer kvalitetsparametere vil rapporteres.
Måleusikkerhet
Panelet er målrettet og vil ikke inkludere alle mulige varianter. For fusjonstranskripter kan sjeldent forekommende fusjonspartnere eller bruddpunkt medføre negativt resultat.
Materiale av redusert kvalitet (lav konsentrasjon, fragmentert, deaminert) kan gi redusert sensitivitet.
