Genetisk karakterisering av Clostridium difficile isolater.

Renkultur av Clostridium difficile.

Rekvireres av laboratoriet på grunnlag av påvist C. difficile toksingen i fæces med påfølgende dyrkning av C. difficile.

Ved PCR ribotyping kopieres og masseproduseres regionen mellom 16s og 23s i rRNA operonet. Antall regioner og størrelsen på denne regionen varierer mellom ulike stammer og dette gir en variasjon av PCR produkter der antall og størrelse vil variere fra stamme til stamme.

Stammens ribotype. 

Etter amplifisering undersøkes DNA-fragmenter ved gelelektroforese. Det vil opptre en rekke bånd, båndmønsteret sjekkes mot et referansebibliotek av C. difficile stammer og dette avgjør hvilken ribotype isolatet kan karakteriseres som.

Ribotyping kan differensiere mellom >800 forskjellige typer av C. difficile.