Substitusjonsbehandling ved lavt stoffskifte godkjennes vanligvis. Dette forutsetter at stoffskiftet er normalt, kontrolleres hos behandlende lege og at dosering har vært uendret i minst 3 måneder. Vanligvis godkjente preparater er blant annet Euthyrox, Levaxin og Liothyronin.
Behandling ved høyt stoffskifte godkjennes ikke, se stoffskiftesykdommer. Dette gjelder for eksempel ved bruk av Neo-Mercazole.