Tarmpatogene bakterier, virus og parasitter

Alle prøver der det er rekvirert undersøkelse for tarmpatogene bakterier, virus eller Clostridioides difficile toksin undersøkes med en molekylærbiologisk påvisning (PCR) av flere diarefremkallende agens.

• Bakterier: Campylobacter spp, Salmonella spp, Shigella spp / Enteroinvasiv E. coli (EIEC), Yersinia enterocolitica, Clostridium difficile, Enterohemoragisk E. coli (EHEC), Enteropatogen E. coli (EPEC), Enteroaggregativ E. coli (EAEC) og Enterotoksinogen E. coli (ETEC).
• Virus: Norovirus GI og GII, rotavirus A, adenovirus F (serotype 40/41), astrovirus og sapovirus (G1, 2 og 4).
• Parasitter: Giardia lamblia, Cryptosporidium spp og Entamoeba histolytica.

• Mistanke om gastroenteritt. Angi reiseanamnese og evt. antatt smittekilde på rekvisisjonen.
• Ved diare etter reise til tropisk område med tilknytning til sjø (bading, inntak av sjømat) utføres i tillegg dyrkning av Vibrio spp. og de beslektede Aeromonas spp og Plesiomonas.
• Kliniske opplysninger om blodig diarè eller HUS-symptomer kan gi indikasjon for utvidet EHEC-undersøkelse.
• Indikasjon for utvidet EPEC-undersøkelse er aktuelt hos barn under 5 år med langvarig diare, diare etter opphold i U-land eller utbrudd i barnehage/barneavdeling.

Bruk FecalSwab transportmedium. Samle en liten mengde fæces ved å sette hele spissen av vattpinnen med nylonfiber inn i fæcesprøven og roter. Velg et blodig, slimete eller vannaktig område av fæcesprøven. Påse at det finnes synlig fæces på vattpinnen etter prøvetaking. OBS! Vattpinnen skal ikke brukes som en skje. Kontroller at den innsamlede prøven ikke overstiger maksimumslinjen som er markert på mediet.

Ved akutt diaré er én prøve vanligvis tilstrekkelig til å fastslå etiologisk agens.

Dersom det er indikasjon for mikroskopisk undersøkelse av andre parasitter enn de som påvises ved den molekylærbiologiske undersøkelsen, se Parasitter mikroskopi fæces).

Se Fæcesprøver under kapittelet Prøvetaking.

• Må sendes i transporthylse av hardplast på grunn av smittefare.
• Bør oppbevares i kjøleskap og undersøkes innen 2 døgn etter prøvetakning.

Mikrobiologi, Sykehuset Innlandet, Lillehammer.

• Påvist/Ikke påvist for hver enkel analyse.
• Ved positiv PCR vil aktuelle bakterier bli forsøkt dyrket for nærmere identifikasjon og eventuelt resistensbestemmelse. Rekvirenten mottar separat svar på dyrkningsanalysen.

• Ved funn av Salmonella Typhi, S. Paratyphi og enterohemoragisk E. coli (EHEC):
  • Rekvirenten (eller sengeposten der pasienten ligger) får telefonbeskjed om funnet.
• Ved funn av andre tarmpatogene agens:
  • Inneliggende pasient: Sengeposten der pasienten ligger, får telefonbeskjed om funnet.
  • Poliklinisk pasient: Rekvirenten blir vanligvis ikke informert telefonisk om funnet.

• Tarmpatogene bakterier, virus og parasitter (PCR): Analysen utføres daglig (mandag til fredag).
• Tarmpatogene bakterier (dyrkning): Normalt 2-3 dager, avhengig av evt. funn og resistensbestemmelse.

OBS! For kontrollprøver etter tidligere funn av tarmpatogene bakterier, vil kun dyrkning bli utført. Det er viktig å opplyse om hvilket agens som ønskes kontrollert. Henviser til Smittevernveilederen kapittel om Kontroll og oppfølging av pasienter med tarminfeksjoner.

Dersom prøven er tatt i forbindelse med smitteoppsporing rundt et EHEC-tilfelle, vennligst angi dette på rekvisisjonen.

Følgende tilstander er nominativt meldipliktige til MSIS (Gruppe A):

• Campylobacteriose
• Cryptosporidium-infeksjon
• Enteropatogen E. coli-enteritt
• Giardiasis
• Paratyfoidfeber
• Salmonellose
• Shigellose
• Tyfoidfeber
• Yersiniose

Se også MSIS meldepliktige sykdommer for komplett oversikt.

Opplysning om smittested er viktig med tanke på å oppdage innenlands matbårne utbrudd så tidlig som mulig.

• Strategirapport nr 29 feces-bakteriologi.pdf
• Strategimøte 2005-Virale gastroenteritter.pdf
• Strategimøte 2014 Fæcesparasittologi.pdf
• Meldesystem for smittsomme sykdommer (MSIS)