Laktasegenotyping (Laktoseintoleransegentest)

• Klinisk mistanke om laktoseintoleranse fra 3 års alder grunnet magesmerter, diaré og luftplager el.l. (Analysen utføres ikke på barn under 3 år).
• Genanalysen kan brukes både til å påvise og til å utelukke arvelig betinget laktasemangel.
• Analysen kan imidlertid ikke påvise laktasemangel som er sekundær til annen tarmsykdom som cøliaki, akutt gastroenteritt og inflammatorisk tarmsykdom, andre former for melkeintoleranse eller allergi overfor melkeproteiner. En meget sjelden og potensielt livstruende form for genetisk betinget laktasemangel, med fravær av laktase fra fødselen av, kan heller ikke påvises ved denne gentesten.

Pasientforberedelse

Ingen.

Prøvetaking

EDTA-rør

Etterbestilling

Etterbestilling kan ikke utføres på EDTA-glass som har vært brukt på andre analyseinstrumenter, feks. hematologi.

Prøven kan kun etterbestilles i de tilfeller hvor det er tatt prøve til cøliaki HLA DQ2/DQ8 eller HLA-B27.

Oppbevaring

Prøvene oppbevares i 30 dager etter ankomst på laboratoriet.

Enzymet laktase i tynntarmsslimhinnen er nødvendig for å fordøye laktose (melke­sukker). Hos de fleste mennesker i verden avtar laktaseaktiviteten gradvis i barne- eller ungdomsårene til ca. 5–10 % av spedbarnsnivå. Dette fører til nedsatt evne til å fordøye laktose og økt risiko for laktose­intoleranse, med symptomer som magesmerter, luftplager og diaré etter inntak av melk og melkeprodukter. Hos ca. 1/3 av jordens befolkning skjer imidlertid ikke denne enzymnedreguleringen, og de kan også i voksen alder fordøye laktose. Denne egenskapen, som kalles laktasepersistens, har varierende hyppighet i ulike deler av verden og er vanligst i Nord-Europa, med en frekvens på over 90 % i Skandinavia.

Det er funnet at enkeltbasesubstitusjoner (single nucleotide polymorphisms, SNP) i intronsekvenser i genet MCM6, et gen­regulatorisk område lokalisert ca. 14000 basepar unna selve laktasegenet (LCT), påvirker genuttrykket. Endringen fører til at den vanlige nedreguleringen av laktaseaktiviteten etter dieperioden ikke skjer. I Europa samt i områder av Asia skyldes laktasepersistens polymorfismen -13910C >T. I andre deler av verden er denne genvarianten mer sjelden eller fraværende, og laktasepersistens skyldes andre polymorfismer. Genvarianter assosiert med laktasepersistens som hittil er påvist er, i tillegg til -13910C >T, -13907C >G, -13915T >G og -14010G >C  samt -14009T >G.

Tekstet svar. Vanligvis angis hvilken genotype som er påvist og hva dette innebærer.

Kommentarer til referanseområdene
Genotype avhenger av etnisk bakgrunn. 

Tilstedeværelse av T i posisjon -13910, enten i heterozygot (CT) eller homozygot (TT) form, medfører laktasepersistens. Hos en voksen person av europeisk avstamning vil CC-homozygoti tilsi primær (genetisk betinget eller arvelig) laktasemangel. CC-homozygote barn taper laktase gradvis. Det er individuelt når laktasemangelen blir manifest. Hos nord-europeere viser laktasemangelen seg ofte ved 8–12-års alder. Symptomer på laktasemangel er sjelden før 5-års alder. Hvorvidt man opplever laktoseintoleranse eller ikke avhenger av mengden laktose som inntas og individuelle faktorer. Selv om man har genetisk betinget laktase­mangel er det vanlig å tolerere litt melk, ca. 2 dL/døgn. Generelt er det viktig å unngå unødig kostrestriksjon, særlig hos barn hvor melk og melkeprodukter er viktige næringskilder.

Hos personer av ikke-europeisk avstamning er -13910 CC-homozygoti vanlig. De kan imidlertid ha andre genvarianter assosiert med laktasepersistens, men dette avhenger av etnisk bakgrunn. -139015T >G er vanlig i Midtøsten, mens -13907C >G,  er hyppigst påvist i ulike befolkningsgrupper i Øst-Afrika. Alle disse genvariantene nedarves dominant, det vil si at én enkeltbasesubstitusjon i en av de nevnte posisjonene i minst ett allel er tilstrekkelig for å gi laktaspersistens.

Selv om man har en genotype forenlig med primær laktasemangel, betyr ikke dette nødvendigvis at det forklarer pasientens symptomer. Pasienter med primær laktasemangel kan også få sykdom som gir sekundær laktoseintoleranse, og det er viktig at man ikke overser eventuell baken­for­liggende sykdom.

Deteksjon av gentypene 13910/13907 og 13915 ved loop-mediert isothermal amplifikasjon (LAMP).

• Metoden utføres minst en gang per uke

Analysen utføres på LC480II ved seksjon genteknologi og infeksjonsserologi