Genvarianter inkludert i analysen
Genvariant |
Molekylær effekt |
Allelets funksjonelle status |
Referansesekvens MANE Select transcript |
DPYD*2A |
Spleisedefekt |
Ingen funksjon |
NM_000110.4:c.1905+1G >A |
DPYD c.2846A >T | Missens mutasjon | Redusert funksjon | NM_000110.4:c.2846A >T |
DPYD*13 | Antatt destabilisering av proteinet | Ingen funksjon | NM_000110.4:c.1679T >G |
DPYD c.1236G >A | Prematurt stoppkodon (som del av HapB3) | Redusert funksjon | NM_000110.4:c.1236G >A |
Analysen utføres ved Avd. for medisinsk biokjemi, Rikshospitalet.
Avdeling for farmakologi, Rikshospitalet, har medisinskfaglig ansvar for analysene og er ansvarlig for tolkning og rapportering av analysesvar.
Prøvemateriale
EDTA-fullblod, volum: 0,5 mL
Prøvetakingstidspunkt
Ingen restriksjoner
Oppbevaring
Prøven er holdbar flere døgn i romtemperatur, men oppbevaring i kjøleskap anbefales. Ved lengre tids lagring ( >1 mnd) bør prøven fryses.
Forsendelse
Ordinær post, kan sendes i romtemperatur.
Svartid
Svar foreligger vanligvis innen 2 uker, ta kontakt dersom det haster mer.
Rekvisisjon
Se her for bestillingsskjema/rekvisisjon
BS: DPD
Analysemetode
Sanntids-PCR med alleldeteksjon vha. hybridiseringsprober og smeltekurveanalyse.
NLK-kode
NPU 58343: DPYD*2A
NPU 58344: DPYD c.2846A >T
NPU 59110: DPYD c.1236G >A
NPU 59109: DPYD*13
Forekomst av DPYD-genvarianter varierer mellom folkegrupper.
Frekvens av DPYD-genvarianter (allelfrekvens):
Indikasjon
Med denne analysen undersøkes varianter i genet DPYD, som koder for enzymet dihydropyrimidin dehydrogenase (DPD).
DPD er det viktigste enzymet for inaktivering av fluoropyrimidin-legemidlene. European Medicines Agency (EMA) kom i april 2020 med anbefalinger om genotyping av DPYD før oppstart av behandling med fluoropyrimidiner.
Aktuelle legemidler
Terapiområde |
Virkestoff |
Handelsnavn |
Kreft |
fluorouracil kapecitabin tegafur |
Fluorouracil Accord Xeloda, Capecitabine Accord Teysuno |
Kommentar
Pasientens genotype er i utgangspunktet stabil og uendret gjennom hele livet. Det er således normalt ikke indisert å gjenta en genotyping hvis den er utført tidligere og svaret er tilgjengelig for rapportering. Unntak kan være:
Vakttelefon (klinisk farmakolog, farmasøyt): 941 33 218 (hverdager kl 08.30-14.30). Vakttelefonen betjener spørsmål fra rekvirerende lege (ikke pasienter).
CYPinfo
CYPinfo er et beslutningsstøttende verktøy til hjelp for leger som rekvirerer farmakogenetiske analyser. Tjenesten er web-basert og fritt tilgjengelig på http://www.cypinfo.no/. For å bruke CYPinfo må du ha et farmakogenetisk prøvesvar. Verktøyet viser hvordan den enkelte pasients genvarianter påvirker behandling med ulike legemidler. Påviste genvarianter kobles opp mot enkeltlegemidler eller en legemiddelgruppe. Det genereres en rapport som gir en oversikt over hvordan pasientens genetikk kan påvirke effekten av aktuelle legemidler og det gis forslag til hvordan behandlingen kan tilpasses for å veie opp for dette.