Mikrobiologi - generelt om tolkning av analyser og funn

Dette dokumentet er en generell orientering om laboratoriets rutiner for tolkning av funn.

For tolkning av analysesvar henvises til Smittevernveileder på FHIs hjemmeside https://www.fhi.no/nettpub/smittevernveilederen/ .

Om kommentarer lagt til svaret

Laboratoriet vil ofte kommentere den mottatte prøven og/eller prøveresultatet.

A) Forhold knyttet til prøven som medfører usikkerhet eller redusert sannsynlighet for at resultatet er riktig. Eksempler er:

• Lang forsendelsestid
• Feilemballering
• Mangelfull merking av prøve eller rekvisisjon
• Lite eller ikke optimalt prøvemateriale mottatt

B) Faglige vurderinger knyttet til funnet. Eksempler er:

• Usikker klinisk betydning
• Forurensning sannsynlig
• Kolonisering sannsynlig

Normalflora

Ofte konkluderes det med "normal flora" som resultat på en generell bakteriologisk undersøkelse.
Alle kroppens overflater og åpninger er kolonisert med bakterieflora som gir oss en viss grad av beskyttelse mot infeksjonssykdom. Sammensetningen av denne normale floraen varierer med lokalisasjon, og den kan i noen grad variere fra individ til individ.

Normalfloraen hos en person kan påvirkes og endres av mange forhold som for eksempel:

• hygienisk standard i omgivelsene
• kontakt med andre personer
• matinntak
• geografisk oppholdssted
• antibiotikabehandling

Normalfloraen kan også inneholde mikrober som kan gi sykdom, eks. gule stafylokokker i nesen, pneumokokker og Haemophilus influenzae i halsen, Candida i luftveiene, Enterobacteriaceae i feces, Gruppe B streptokokker i vagina.

Besvarelse "Normal flora" utelukker ikke små mengder patogene mikrober som krever særskilt undersøkelse for å kunne bli oppdaget.
Dersom en prøve viser renkultur eller klar dominans av en patogen mikrobe vil dette funnet bli rapportert selv om den også kan inngå i normalfloraen.
Funn av bakterier som sannsynligvis stammer fra område utenfor det man ønsker å teste, vil bli kommenter med 'mulig forurensning' eller 'forurensning sannsynlig'.

Kolonisering:

Overflatiske sår vil alltid, selv om de i utgangspunktet var "rene", koloniseres av omliggende normalflora. Vekstbetingelsene i selve såret vil være annerledes enn i omgivelsene og den koloniserende flora vil derfor ikke nødvendigvis være et speilbilde av omliggende normalflora. Enkeltelementer av denne vil kunne dominere. Det kan være vanskelig å vite i hvilken grad sekundær kolonisering bidrar til sårinfeksjon og hindrer tilheling. Enkelte mikrober vil alltid vurderes å være patogene i slik sammenheng, for eksempel gule stafylokokker.

Usikkerhet ved analysesvar
Alle analysesvar er forbundet med noen grad av usikkerhet.

• Preanalytisk usikkerhet
  Den største usikkerheten er knyttet til identifikasjon av pasient og prøve.
  Andre forhold som bidrar til usikkerhet er prøvetaking og forsendelse: Hvor og når prøven er tatt, tilstrekkelig og rett mengde prøvemateriale, rett emballasje, oppbevaring, forsendelsestid mm.
• Analytisk usikkerhet
  Kan inndeles i to kategorier:
  • Ikke-målbare usikkerhetsbidrag: Oppbevaring og holdbarhet av reagenser, drift og vedlikehold av analyseinstrumenter, variasjon i kvalitet på kontrollmaterialer,
  • Målbare usikkerhetsbidrag: Pipettevolum, analyseresultater av kontroller i kvantitative analyser mm.
• Postanalytisk usikkerhet
  består i hovedsak av vurdering av analysesvar basert på kliniske opplysninger i rekvisisjonen og utsendelse av svar til rekvirent.
  Et negativt resultat utelukker ikke med sikkerhet infeksjon, hverken av agens i vårt analyserepertoar eller agens som ikke inngår i vårt analyserepertoar. Positivt resultat/ påvist agens er ikke nødvendigvis definitive årsak til infeksjon og utelukker heller ikke koinfeksjon med annet agens»

Normalflora: Mikroorganismer som normalt finnes på kroppens hud og åpninger uten at de gir infeksjon.
Kolonisering: Ved kolonisering er vekst og død av de koloniserende bakteriene i likevekt. De er i balanse og under kontroll av immunforsvaret. De lever altså på stedet, men forårsaker ikke infeksjon. Ved forrykkelse av balansen kan de gi infeksjon, men vil altså normalt ikke gjøre skade.