Indikasjoner: Mistanke om monogent betinget tidlig debuterende inflammatorisk tarmsykdom.
Genpanelet inkluderer gener som har dokumentert årsakssammenheng med tidlig debuterende inflammatorisk tarmsykdom (IBD) og enterokolitt.
Inklusjonskriterier for rekvirering av panelet:
Panelet er basert på følgende PanelApp-paneler; Gastrointestinal epithelial barrier disorders,
Infantile enterocolitis & monogenic inflammatory bowel disease og Intestinal failure or congenital diarrhoea, samt artikkel O`Brien KJ et al., J Intern Med 2021. Genene IKBKG og NCF1 er ekskludert grunnet tekniske vansker.
Det utføres en genomsekvensering som inkluderer en sekvens- og kopitallsanalyse, med filtrering for varianter i genene som inngår i genpanel Tidlig debuterende inflammatorisk tarmsykdom v03.
For informasjon om hvilke gener som inngår i tidligere, utgåtte versjoner av panelet, vises det til genliste på Genetikkportalen (www.genetikkportalen.no).
Tidlig debuterende inflamatorisk tarmsykdom (IBD) versjon 03
ADA |
ADAM17 |
ADAMTS3 |
AGR2 |
AICDA |
ANGPTL3 |
ANO1 |
AP1S1 |
AP3B1 |
AP3D1 |
APOB |
ARX |
BACH2 |
BLOC1S3 |
BLOC1S5 |
BLOC1S6 |
BTK |
CCBE1 |
CD3G |
CD40LG |
CD55 |
CLMP |
CTLA4 |
CYBA |
CYBB |
DCLRE1C |
DGAT1 |
DKC1 |
DOCK8 |
DTNBP1 |
EGFR |
EPCAM |
FAT4 |
FERMT1 |
FLNA |
FOXP3 |
G6PC3 |
GUCY2C |
HPS1 |
HPS3 |
HPS4 |
HPS5 |
HPS6 |
ICOS |
IL10 |
IL10RA |
IL10RB |
IL21 |
IL2RA |
IL2RG |
ITGB2 |
KMT2D |
LCT |
LIG4 |
LRBA |
MEFV |
MTTP |
MVK |
MYO5B |
NCF2 |
NCF4 |
NEUROG3 |
NOD2 |
OTULIN |
PCSK1 |
PIK3CD |
PIK3R1 |
PLCG2 |
PLVAP |
PTEN |
RAG1 |
RAG2 |
RET |
RFX6 |
RTEL1 |
SAMD9 |
SAR1B |
SH2D1A |
SI |
SKIC2 |
SKIC3 |
SLC10A2 |
SLC26A3 |
SLC37A4 |
SLC39A4 |
SLC5A1 |
SLC9A3 |
SPINT2 |
STAT1 |
STAT3 |
STX3 |
STXBP2 |
TERT |
TGFBR1 |
TGFBR2 |
TMPRSS15 |
TTC7A |
WAS |
WNT2B |
XIAP |
ZAP70 |
Det utføres genomsekvensering med kopitallsanalyse.