Genpaneler som begynner på
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
Æ
Ø
Å

Tidlig debuterende inflammatorisk tarmsykdom

Sist oppdatert: 26.09.2024
Utgiver: Oslo universitetssykehus
Versjon: 0.13
Kopier lenke til dette emnet
Foreslå endringer/gi kommentarer

Panelbeskrivelse 

Indikasjoner: Mistanke om monogent betinget tidlig debuterende inflammatorisk tarmsykdom.

 

Genpanelet inkluderer gener som har dokumentert årsakssammenheng med tidlig debuterende inflammatorisk tarmsykdom (IBD) og enterokolitt.

Inklusjonskriterier for rekvirering av panelet:

  • Tidlig debuterende inflammatorisk tarmsykdom (VEO-IBD) eller enterokolitt med debut før 10-17 års alder.
  • Det skal ikke foreligge mistanke om akutt infeksiøs gastroenteritt/enterokolitt.
  • Mistanken om IBD bør være godt underbygget, vanligvis etter fecaltest og endoskopi samt biopsi med typisk histologisk bilde. Et histologisk bilde med epitelial dysmorfologi er også indikasjon for rekvirering av panelet.
  • Panelet kan også rekvireres ved behandlingsrefraktær IBD etter standard medikamentopptrapping.

 

 

 

Panelet er basert på følgende PanelApp-paneler; Gastrointestinal epithelial barrier disorders,

Infantile enterocolitis & monogenic inflammatory bowel disease og Intestinal failure or congenital diarrhoea, samt artikkel O`Brien KJ et al., J Intern Med 2021. Genene IKBKG og NCF1 er ekskludert grunnet tekniske vansker.

 

Det utføres en genomsekvensering som inkluderer en sekvens- og kopitallsanalyse, med filtrering for varianter i genene som inngår i genpanel Tidlig debuterende inflammatorisk tarmsykdom v03.

 

For informasjon om hvilke gener som inngår i tidligere, utgåtte versjoner av panelet, vises det til genliste på Genetikkportalen (www.genetikkportalen.no).

Genliste 

Tidlig debuterende inflamatorisk tarmsykdom (IBD) versjon 03

 

ADA
ADAM17
ADAMTS3
AGR2
AICDA
ANGPTL3
ANO1
AP1S1
AP3B1
AP3D1
APOB
ARX
BACH2
BLOC1S3
BLOC1S5
BLOC1S6
BTK
CCBE1
CD3G
CD40LG
CD55
CLMP
CTLA4
CYBA
CYBB
DCLRE1C
DGAT1
DKC1
DOCK8
DTNBP1
EGFR
EPCAM
FAT4
FERMT1
FLNA
FOXP3
G6PC3
GUCY2C
HPS1
HPS3
HPS4
HPS5
HPS6
ICOS
IL10
IL10RA
IL10RB
IL21
IL2RA
IL2RG
ITGB2
KMT2D
LCT
LIG4
LRBA
MEFV
MTTP
MVK
MYO5B
NCF2
NCF4
NEUROG3
NOD2
OTULIN
PCSK1
PIK3CD
PIK3R1
PLCG2
PLVAP
PTEN
RAG1
RAG2
RET
RFX6
RTEL1
SAMD9
SAR1B
SH2D1A
SI
SKIC2
SKIC3
SLC10A2
SLC26A3
SLC37A4
SLC39A4
SLC5A1
SLC9A3
SPINT2
STAT1
STAT3
STX3
STXBP2
TERT
TGFBR1
TGFBR2
TMPRSS15
TTC7A
WAS
WNT2B
XIAP
ZAP70

Metodebeskrivelse og -begrensninger 

Det utføres genomsekvensering med kopitallsanalyse.

Se Metodebeskrivelse og -begrensninger