Fæces multipleks PCR
Indikasjon
Se også Gastroenteritter i Håndbok i Infeksjonsmedisin.
Laboratoriet benytter multipleks real-time PCR for påvisning av:
- Bakterier*
- Yersinia enterocolitica
- Salmonella spp.
- Campylobacter spp.
- Shigella spp./EIEC
- Parastitter
- Cryptosporidium spp
- Giardia lamblia
- Entamoeba histolytica
- Virus (se egne analyser)
*Positive funn av bakterier kan bli dyrket for typing og eventuell resistensbestemmelse .
I spesielle situasjoner hvor andre bakterier kan være årsak til pasientens symptomer, vil i tillegg spesialdyrkning kunne utføres. Det er derfor avgjørende at gode kliniske opplysninger er angitt!
| Indikasjon | Spesialdyrkning |
| Blodig diaré | Enterohemoragiske E. coli (EHEC) |
| Gastroenteritt etter inntak av sjømat | Aeromonas, Plesiomonas, Vibrio-arter |
| Kraftig vandig diaré i kombinasjon med antatt smittested i land der kolera er endemisk | V. cholerae |
| Langvarig diaré ( > 14 dager) hos barn | Enteropatogene E. coli (EPEC) |
| Kontrollprøver etter tidligere positive fæcesprøver | |
| Opphold i endemiske områder, forhøyet IgE, langvarig diaré > 3 uker | Andre parasitter enn de avdelingens PCR detekterer |
Prøvemateriale
- Fæcesprøver uten tilsetning eller i flytende bakt-transportmedium (flytende amies med flocket swab og flytende Cary Blair) ved at penselen dyppes i avføringen.
- Tarmbiopsi i steril universalcontainer med litt saltvann.
- Abscessinnhold, duodenalaspirat i steril universalcontainer uten tilsetning.
Rekvirering
Elektronisk rekvirering anbefales.
Rekvirenter uten slik tilgang, se Rekvisisjoner
Opplysning om smittested er viktig med tanke på å oppdage innenlands matbårne utbrudd så tidlig som mulig.
Prøvetaking og forsendelse
Se Fæcesprøver under kapittelet Prøvetaking.
- Må sendes i transporthylse av hardplast på grunn av smittefare.
- Bør oppbevares i kjøleskap og undersøkes innen 3 døgn etter prøvetakning.
Undersøkelsesprinsipp
Kvalitativ påvisning av de beskrevne gastroenteritt-agens ved hjelp av sanntids polymerasereaksjon (PCR).
Utførende laboratorium
Enhet for bakteriologi, OUS Ullevål.
Svar
Påvist / Ikke påvist for hver enkelt analyse.
Svartid
1-3 dager.
Merknader
Følgende tilstander er nominativt meldipliktige til MSIS (Gruppe A)
- Campylobacteriose
- Cryptosporidium-infeksjon
- Enteropatogen E. coli-enteritt
- Giardiasis
- Paratyfoidfeber
- Salmonellose
- Shigellose
- Tyfoidfeber
- Yersiniose
Se også MSIS meldepliktige sykdommer for komplett oversikt.
Opplysning om smittested er viktig med tanke på å oppdage innenlands matbårne utbrudd så tidlig som mulig.
Akkreditert
Analysen er ikke akkreditert.
