Formalinfiksert, parafininnstøpt (FFPE) vev.

Minimum 20% neoplastiske celler.

Forventet svartid er innen 15 virkedager.

EpiDirect® MLH1 Methylation qPCR Assay er et kvalitativt og semi-automatisk real-time Polymerase Chain Reaction (PCR) assay for påvisning av metylering i genet MutL Homolog1 (MLH1). Metyleringsstatusen til 4 CpG-seter i MLH1-promotoren undersøkes. Disse befinner seg på kromosom 3, GRC37.p13, fra 37,034,770 til 37,034,790.

Resultatet rapporteres som påvist metylering eller ikke påvist metylering.

Metyleringstatusen til MLH1 baseres på differansen mellom Ct (ΔCt) i FAM-kanal (MLH1) og HEX/VIC-kanal (internt referansegen) for hver prøve. 

Prøvene kjøres i duplikat, og gjennomsnittlig ΔCt (ΔCtmean) regnes ut fra duplikatene. 

Disse sammenlignes opp mot ΔCtmean til positiv kontroll (15% metylert).

Prøver med en høyere ΔCtmean enn den positive kontrollen er metyleringsnegative, mens en lavere ΔCtmean angir metyleringspositive.

• Testen gir kun et kvalitativt svar (metylert/ikke metylert).
• Et negativt svar (ikke metylert) ekskluderer ikke muligheten for at metylering er til stede, men under deteksjonsgrensen til analysen.
• Sjeldne mutasjoner i det undersøkte området kan hemme deteksjonen av metylering.

• IFU - EpiDirect MLH1 v3.3_RUO.pdf
• A qPCR technology for direct quantification of methylation in untreated DNA