Molekylære analyser, solide svulster
NRAS
Viktig informasjon
- Denne testen utføres med IdyllaTM NRAS-BRAF Mutation Test fra Biocartis og vil ikke kunne detektere alle klinisk signfikante varianter.
- NRAS kan også inngå i en analysepakke på HTS som vil kunne påvise ytterligere varianter.
- Dersom NRAS er rekvirert sammen med KRAS, vil det først analyseres for varianter i KRAS. Hvis positiv for variant i KRAS, vil det ikke gjøres videre analyse av NRAS.
Prøvemateriale
Formalinfiksert, parafininnstøpt (FFPE) vev.
Patologilaboratoriene behøver ikke å sende fra seg parafinblokker. DNA isoleres fra snitt montert på objektglass. Innsendt snitt vil ikke bli returnert.
HE-farget snitt + 4 stk. 10μm ufargede snitt montert på objektglass (evt. blokk, dersom det ikke er mulighet for å lage snitt). Minimum 10% neoplastiske celler.
Forventet svartid
Forventet svartid er innen 7 virkedager.
Undersøkelsesprinsipp
Idylla™ NRAS-BRAF Mutation Test er en fullautomatisert, multipleks PCR-test som utføres på Biocartis Idylla™-systemet.
Svar
Resultatet rapporteres som:
- Variant påvist i NRAS (med beskrivelse av hvilken variant som ble påvist)
- Varianter ikke påvist
- Inkonklusiv
Tolkning
En internkontroll tester for mengde amplifiserbar DNA i prøven. Idylla programvare tolker signalene fra PCR-reaksjonen i internkontrollen og pasientprøven og avgjør genotype ved å beregne forskjellen mellom NRAS-kontrollens Cq og Cq som ble oppnådd for variantsignaler.
IdyllaTM kan påvise følgende varianter i NRAS:
Ekson 2: G12D, G12C, G12S, G12A/V, G13D, G13R/V
Ekson 3: A59T, Q61K, Q61R, Q61L, Q61H
Ekson 4: K117N, A146T/V
Måleusikkerhet
- Metoden er validert med FFPE fra vev med opphav fra kolorektal tumor.
- Bruk av prøver som ikke oppfyller kriterier for mengde vev, amplifiserbart DNA eller andel neoplastiske celler kan gi upålitelige eller ugyldige resultat eller at mutasjoner nær LOD ikke blir påvist.
- Ved heterogenitet av prøver eller flere varianter, rapporteres kun den påviste dominante varianten.
- Idylla™ NRAS-BRAF Mutation Test kan påvise allelefrekvenser ≥ 5 % i NRAS-genet i kodon 12 og 61, >10 % for mutasjoner i kodon 13, 59, 117 og > 15 % i NRAS-genet i kodon 146.
