DPYD

Genvarianter inkludert i analysen

Analysen utføres ved Avd. for medisinsk biokjemi, Rikshospitalet.

Avdeling for farmakologi, Rikshospitalet, har medisinskfaglig ansvar for analysene og er ansvarlig for tolkning og rapportering av analysesvar.

Prøvemateriale

EDTA-fullblod, volum: 0,5 mL

Prøvetakingstidspunkt

Ingen restriksjoner

Oppbevaring

Prøven er holdbar flere døgn i romtemperatur, men oppbevaring i kjøleskap anbefales. Ved lengre tids lagring ( >1 mnd) bør prøven fryses.

Forsendelse

Ordinær post, kan sendes i romtemperatur.

Svartid

Svar foreligger vanligvis innen 2 uker, ta kontakt dersom det haster mer.

Analysemetode

Sanntids-PCR med alleldeteksjon vha. hybridiseringsprober og smeltekurveanalyse.

NLK-kode

NPU 58343: DPYD*2A

NPU 58344: DPYD c.2846A >T

NPU 59110: DPYD c.1236G >A

NPU 59109: DPYD*13

Forekomst av DPYD-genvarianter varierer mellom folkegrupper.

Frekvens av DPYD-genvarianter (allelfrekvens):

• *2A (rs3918290): < 1 – 2 % blant kaukasiere og asiater. Allelfrekvensen i afrikanske populasjoner er i mindre grad kjent, men er sannsynligvis < 1 %.
• c.2846A >T (rs67376798): < 1 – 2 % blant kaukasiere og < 1 % i andre populasjoner.
• *13 (rs55886062): < 0,1 % blant kaukasere
• c.1236G >A (rs56038477): ca.2-6 % blant kaukasiere

Indikasjon

Med denne analysen undersøkes varianter i genet DPYD, som koder for enzymet dihydropyrimidin dehydrogenase (DPD).
DPD er det viktigste enzymet for inaktivering av fluoropyrimidin-legemidlene. European Medicines Agency (EMA) kom i april 2020 med anbefalinger om genotyping av DPYD før oppstart av behandling med fluoropyrimidiner.

Aktuelle legemidler

Kommentar

Pasientens genotype er i utgangspunktet stabil og uendret gjennom hele livet. Det er således normalt ikke indisert å gjenta en genotyping hvis den er utført tidligere og svaret er tilgjengelig for rapportering. Unntak kan være:

• Ønske om ny genotyping med en mer omfattende metode: Hvis man tidligere bare har fått undersøkt én eller noen få DNA-sekvensvarianter i det aktuelle genet, kan det være aktuelt å teste på igjen med en ny eller mer omfattende metode som fanger opp flere varianter.
• Pasienten er transplantert: Stamcelletransplantasjon tilfører donorleukocytter, noe som vil gi endret genotype ved analysering av blodprøve. Organtransplantasjon tilfører organ med donors genotype. Blodceller og øvrige vev er da uendret.
• Mistanke om feil: Selv om det er sjelden, kan det forekomme berettiget mistanke om feil analyseresultat. I så fall kan ny genotyping være indisert. I tillegg til prøveforbytning eller feil knyttet til analysering eller rapportering, kan det ved leukopeni i forbindelse med graviditet eller hos personer som får ordinær blodoverføring (én enhet SAG-blod kan inneholde inntil 1 million leukocytter) forekomme at det i en periode på inntil noen måneder blir en tilblanding og proliferasjon av fosters eller blodgivers leukocytter (mikrokimerisme) som kan gi endret genotyperesultat.
• Klonal ekspansjon av mutert cellelinje hos pasienten.

CYPinfo

CYPinfo er et beslutningsstøttende verktøy til hjelp for leger som rekvirerer farmakogenetiske analyser. Tjenesten er web-basert og fritt tilgjengelig på http://www.cypinfo.no/. For å bruke CYPinfo må du ha et farmakogenetisk prøvesvar. Verktøyet viser hvordan den enkelte pasients genvarianter påvirker behandling med ulike legemidler. Påviste genvarianter kobles opp mot enkeltlegemidler eller en legemiddelgruppe. Det genereres en rapport som gir en oversikt over hvordan pasientens genetikk kan påvirke effekten av aktuelle legemidler og det gis forslag til hvordan behandlingen kan tilpasses for å veie opp for dette.

Vakttelefon (klinisk farmakolog, farmasøyt): 941 33 218 (hverdager kl 08.30-14.30). Vakttelefonen betjener spørsmål fra rekvirerende lege (ikke pasienter).

• Se avdelingens hjemmeside
• https://tidsskriftet.no/2020/10/debatt/genotyping-kan-gi-faerre-bivirkninger-ved-kreftbehandling
• Anbefaling fra EMA