Analyser som begynner på ...
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
Æ
Ø
Å

KIT

Sist oppdatert: 04.02.2024
Utgiver: Oslo universitetssykehus
Versjon: 1.4
Forfattere: Geir Kongelf, Iselin Pollen Syversen, Jeanne-Marie Berner
Kopier lenke til dette emnet
Foreslå endringer/gi kommentarer

Viktig informasjon 

Ved rekvirering av KIT vil analysen utføres med Sanger sekvensering. KIT kan også inngå i en analysepakke på HTS.

Prøvemateriale 

Formalinfiksert, parafininnstøpt (FFPE) vev.

Forventet svartid 

Forventet svartid er innen 15 virkedager.

Undersøkelsesprinsipp 

Ekson 9 og 11 i NM_000222.3 (KIT) analyseres ved hjelp av polymerase kjedereaksjon (PCR) og Sanger sekvensering.

Svar 

Varianter beskrives med nomenklatur i henhold til Human Genome Variation Society (HGVS).

Tolkning 

Varianter detekteres visuelt ved å sammenligne baserekkefølgen til prøven mot referansesekvensen til det spesifikke genet ved hjelp av analyseprogrammene Mutation Surveyor og Sequencing Analysis.

Måleusikkerhet 

Varianter kan detekteres ned til ca. 20% allelfrekvens i villtype genomisk DNA.