Genpaneler som begynner på
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
Æ
Ø
Å

Anemi og cytopeni

Sist oppdatert: 19.09.2024
Utgiver: Oslo universitetssykehus
Versjon: 0.3
Kopier lenke til dette emnet
Foreslå endringer/gi kommentarer

Panelbeskrivelse 

Indikasjoner: Mistanke om monogen anemi eller cytopeni.

 

Relevante tilstander/indikasjoner er bl.a. Fanconi, Blackfan-Diamond, aplastisk anemi eller pancytopeni. Ta kontakt med laboratorielege på 23016636 ved spørsmål. Genpanelet er inntil videre det mest dekkende også ved mistanke om dyskeratosis congenita. Genpanelet er ikke egnet for påvisning av somatiske mutasjoner ved beinmargssvikt, MDS og hematologisk malignitet.

 

Genlisten er bygget på følgende genpaneler i Genomics Englands PanelApp:

Confirmed Fanconi anaemia or Bloom syndrome, Cytopenia - NOT Fanconi anaemia, Cytopenias and congenital anaemias, Rare anaemia. De fleste gener knyttet til dyskeratosis congenita (Genereviews-artikkel) er inkludert.

 

Beinmargssvikt som del av MDS og hematologisk malignitet er ikke en indikasjon, og gener knyttet til disse fenotypene (ofte ved somatiske mutasjoner) er i all hovedsak ikke inkludert. Vi benytter allelratiofiltrering på 20% og leter ikke etter varianter med lavgradig mosaikk ved analyse av dette genpanelet.

Det utføres en genomsekvensering som inkluderer en sekvens- og kopitallsanalyse, med filtrering for varianter i genene som inngår i genpanel for anemi og cytopeni v1.

 

Se Metodebeskrivelse og -begrensninger

 

For informasjon om hvilke gener som inngår i panelet, vises det til genliste på Genetikkportalen (www.genetikkportalen.no).

Genliste 

Anemi og cytopeni versjon 01

 

ABCB7
ABCG5
ABCG8
ACD
ADA2
ADAMTS13
AK1
AK2
ALAS2
ALDOA
AMN
ANK1
ANKRD26
BLM
BRCA1
BRCA2
BRIP1
CBLIF
CD59
CDAN1
CDIN1
CLPB
CSF3R
CTC1
CUBN
CXCR4
CYB5R3
CYCS
DDX41
DHFR
DKC1
DNAJC21
EFL1
ELANE
EPB41
EPB42
ERCC4
ERCC6L2
ETV6
FANCA
FANCB
FANCC
FANCD2
FANCE
FANCF
FANCG
FANCI
FANCL
FYB1
G6PC3
G6PD
GATA1
GATA2
GCLC
GFI1
GLRX5
GPI
GSR
GSS
HAX1
HBA1
HBA2
HBB
HBG1
HBG2
HEATR3
HK1
HSPA9
JAGN1
KCNN4
KIF23
KLF1
LARS2
LPIN2
MECOM
MPL
MTR
MTRR
MYSM1
NBN
NHP2
NT5C3A
PALB2
PARN
PFKM
PIEZO1
PKLR
PUS1
RAD51
RAP1B
RHAG
RMRP
RPA1
RPL11
RPL15
RPL31
RPL35A
RPL5
RPL9
RPS10
RPS19
RPS24
RPS26
RPS28
RPS29
RPS7
RTEL1
SAMD9
SAMD9L
SBDS
SEC23B
SLC11A2
SLC19A2
SLC25A38
SLC2A1
SLC4A1
SLX4
SPTA1
SPTB
SRC
SRP54
STN1
TAFAZZIN
TCN2
TERC
TERT
TF
THPO
TINF2
TMPRSS6
TOP3A
TPI1
TRNT1
UBE2T
UMPS
UROS
USB1
VPS45
VPS4A
WAS
WIPF1
WRAP53
XK
YARS2