Analyser
- Acanthamoeba DNA
- Acanthamoeba dyrkning
- Actinomyces dyrkning
- Adenovirus antigen (fæces)
- Adenovirus DNA
- Adenovirus DNA (fæces)
- Anti-Dnase B (Gr. A streptokokk-serologi)
- Anti-streptolysin (AST; Gr. A streptokokk-serologi)
- Aspergillus DNA
- Aspergillus galaktomannan antigen
- Astrovirus RNA
- Bacillus anthracis DNA
- Bakterie mikroskopi
- Bakterie sekvensering
- Barnemark (Enterobius vermicularis) mikroskopi
- Beta-glukan
- Beta-hemolytiske streptokokker dyrkning
- BK virus DNA
- BK virus DNA kvantitering
- Blastomyces dermatitidis antistoff
- Blodkultur (bakterier, bakterier og sopp)
- Blodkultur (mykobakterier)
- Bordetella pertussis (kikhoste) DNA
- Bordetella pertussis (kikhoste) toksin IgG
- Borrelia burgdorferi IgG
- Borrelia IgG/IgM immunoblot
- Borrelia burgdorferi IgM
- Brucella dyrkning
- Burkholderia cepacia dyrkning
- Campylobacter jejuni IgA, IgM og IgG
- Chlamydia pneumoniae DNA
- Chlamydia trachomatis DNA
- Clostridium difficile dyrkning
- Clostridium difficile ribotyping
- Clostridium difficile toksinpåvisning
- Coccidioides immitis/posadasii antistoff
- Corynebacterium diphtheriae dyrkning
- Cryptosporidium DNA
- Cytomegalovirus DNA
- Cytomegalovirus DNA kvantitering
- Cytomegalovirus (CMV) IgG
- Cytomegalovirus IgG aviditet
- Cytomegalovirus (CMV) IgM
- Cytomegalovirus-IGRA (cellulær immunitet mot CMV)
- Cytomegalovirus resistensbestemmelse
- Dermatofytt DNA
- Dientamoeba fragilis DNA
- Dyrkning av abscess/pussprøver
- Dyrkning av autopsimateriale
- Dyrkning av biopsier/vevsprøver
- Dyrkning av fæcesprøver
- Dyrkning av genitalprøver
- Dyrkning av intravasale kateterprøver
- Dyrkning av morsmelk
- Dyrkning av nedre luftveisprøver
- Dyrkning av spinalvæske
- Dyrkning av sterile væsker, andre
- Dyrkning av sårsekret
- Dyrkning av urin
- Dyrkning av ØNH-prøver
- Dyrkning av øyeprøver
- Echinococcus antistoff
- Echinococcus mikroskopi
- E coli DNA
- EHEC undersøkelse
- Entamoeba histolytica antistoff
- Entamoeba histolytica DNA
- Entamoeba histolytica DNA
- Enterovirus D68 RNA
- Enterovirus RNA
- Epstein-Barr virus DNA
- Epstein-Barr virus DNA kvantitering
- Epstein-Barr virus (EBV) EBNA IgG
- Epstein-Barr virus (EBV) VCA IgG
- Epstein-Barr virus (EBV) VCA IgM
- ESBL-screening
- ETEC undersøkelse
- Filaria antistoff
- Francisella tularensis dyrkning
- Fæces multipleks PCR
- Giardia lamblia DNA
- Haemophilus influenzae DNA
- Helicobacter pylori dyrkning
- Helicobacter pylori IgG
- Hepatitt A virus (HAV) antistoff
- Hepatitt A virus (HAV) IgM
- Hepatitt B virus (HBV) core antistoff
- Hepatitt B virus core totalantistoff (anti-HBc) supplerende test (EIA)
- Hepatitt B virus DNA kvantitering
- Hepatitt B virus e-antigen
- Hepatitt B virus e-antistoff
- Hepatitt B virus (HBV) s-antigen
- Hepatitt B virus surface antigen (HBsAg) konfirmasjonstest
- Hepatitt B virus surface antigen (HBsAg) kvantitering
- Hepatitt B virus (HBV) s-antistoff
- Hepatitt C virus (HCV) antistoff
- Hepatitt C virus antistoff (anti-HCV) supplerende test (EIA)
- Hepatitt C virus antistoff immunoblot
- Hepatitt C virus (HCV) RNA genotype
- Hepatitt C virus RNA kvantitering
- Herpes simplex virus 1,2 DNA
- Herpes simplex virus 2 IgG
- Herpes simplex virus IgG
- Herpes simplex virus IgM
- Histoplasma capsulatum antistoff
- HIV-1/2 konfirmasjonstest (Geenius)
- HIV-1+HIV-2 antistoff+antigen
- HIV-1 antigentest med nøytralisasjon
- HIV-1 DNA (provirus)
- HIV-1 resistensbestemmelse
- HIV-1 RNA kvantitering
- HIV-1 Western blot
- HIV-2 DNA (provirus)
- HIV-2 Western blot
- HTLV-1/2 antistoff
- Humant herpesvirus 6 DNA
- Humant metapneumovirus RNA
- Influensa A, B hurtigtest
- Influensavirus A, B RNA
- Influensavirus A, subtyping
- JC virus DNA
- JC virus DNA kvantitering
- Kryptokokk antigen
- Legionella DNA
- Legionella dyrkning
- Legionellaantigen (urin)
- Leishmania DNA
- Leishmania mikroskopi
- Listeria monocytogenes DNA
- Chlamydia trachomatis (Lymphogranuloma venereum) DNA
- Malaria antigen (hurtigtest)
- Malaria DNA
- Malaria antistoff
- Malaria mikroskopi
- Morbillivirus IgG
- Meningitt og encefalitt hurtigtest
- Mononukleose Heterofile antistoffer
- Morbillivirus IgM
- MRSA-screening
- Mycobacterium tuberculosis rifampicin- og isoniazidresistens
- Mucorales DNA
- Muggsoppdyrkning
- Mycobacterium tuberculosis kompleks DNA
- Mycobacterium tuberculosis kompleks DNA hurtigtest
- Mycobacterium tuberculosis rifampicinresistens (hurtigtest)
- Mycoplasma genitalium DNA
- Mycoplasma genitalium DNA (Makrolidresistens)
- Mycoplasma pneumoniae DNA
- Mykobakteriedyrkning
- Mykobakterier (syrefaste staver) mikroskopi
- Neisseria gonorrhoeae DNA
- Neisseria gonorrhoeae (gonokokk) dyrkning
- Neisseria meningitidis DNA
- Nocardia dyrkning
- Norovirus RNA
- Dermatofyttdyrkning
- Parainfluensavirus 1,2,3,4 RNA
- Parasitter mikroskopi (blod)
- Parasitter mikroskopi (fæces)
- Parechovirus RNA
- Parotittvirus IgG
- Parotittvirus IgM
- Parotittvirus RNA
- Parvovirus B19 DNA
- Humant parvovirus B19 IgG
- Humant parvovirus B19 IgM
- Pneumocystis jirovecii antigen (immunfluorescens)
- Pneumocystis jirovecii DNA
- Pneumokokkantigen
- Reinbremslarve antistoff
- Respiratorisk syncytialt virus (RSV) RNA
- Rhinovirus RNA
- Rotavirus antigen (feces)
- Rotavirus RNA
- Rubellavirus IgG
- Rubellavirus IgM
- SARS-CoV-2 Nukleokapsid Antistoff
- SARS-CoV-2 RNA
- SARS-CoV-2 RNA (PCR) Hurtigtest
- Schistosoma sp. antistoff
- Schistosoma mansoni antistoff
- Schistosoma sp. DNA
- Soppmikroskopi
- Soppsekvensering
- Staphylococcus aureus DNA
- Staphylococcus aureus dyrkning
- Streptococcus pneumoniae DNA
- Streptokokk gruppe B DNA (Streptococcus agalactiae)
- Streptokokk gruppe B dyrkning (Streptococcus agalactiae)
- Strongyloides IgG antistoff
- Syfilis reagin test (RPR)
- TB-IGRA (cellulær immunitet mot M. tuberculosis)
- Toxoplasma gondii DNA
- Toxoplasma gondii IgA
- Toxoplasma gondii IgG
- Toxoplasma gondii IgG aviditet
- Toxoplasma gondii IgM
- Treponema pallidum antistoff (syfilis)
- Treponema pallidum DNA
- Treponema pallidum IgM
- Treponema pallidum TPPA
- Trichomonas vaginalis DNA
- Ureaplasma urealyticum DNA
- Vancomycinresistente enterokokker (VRE) – screening
- Varicella-zoster virus DNA
- Varicella-zoster virus IgG
- Varicella-zoster virus IgM
- Yersinia IgM/IgA/IgG/annen serologi
- Zikavirus IgG
- Zikavirus IgM
- Zikavirus RNA
- Hepatitt B virus DNA (kvalitativ)
- Hepatitt C virus RNA (kvalitativ)
- HIV-1+HIV-2 RNA (kvalitativ)
- HTLV-1/2 antistoff supplerende test (EIA)
- Respiratorisk syncytialt virus (RSV) RNA Hurtigtest
- SARS-CoV-2 spike antistoff (IgG)
- SARS-CoV-2 variant screening (PCR)
- Pneumoni hurtigtest
- Trypanosoma cruzi IgG
- Toxocara IgG
- Anaplasma (Ehrlichia) antistoff
- Anaplasma phagocytophilum DNA
- Bordetella parapertussis DNA
- Borrelia DNA
- Chikungunyavirus IgG
- Chikungunyavirus IgM
- Chikungunyavirus RNA
- Chlamydophila psittaci (ornitose)
- Clostridium tetani IgG
- Importfeber Hurtigtest (Global fever panel)
SARS-CoV-2 variant screening (PCR)
Sist oppdatert: 12.05.2021
Mer informasjon
Utgiver: Norsk forening for medisinsk mikorbiologi
Versjon: 1.0
Tidligere versjoner
Kopier lenke til dette emnet
Kopiert
Foreslå endringer/gi kommentarer
Indikasjon
Screening for kritiske varianter utføres automatisk på alle luftveisprøver med påvist SARS-CoV-2.
Følgende kritiske varianter blir undersøkt (Nextstain/Pangolin klassifikasjon):
- 501Y.V1/B.1.1.7, også kjent som "UK variant"
- 501Y.V2/B1.351, også kjent som "Sør-Afrika variant"
- 501Y.V3 /P1, også kjent som "Brasil variant"
I tillegg utføres helgenomsekvensering for endelig typebestemmelse kun på et utvalg i ledd i nasjonal overvåkning. Svar på sekvensering gis ikke ut enkeltvis, med mindre dette er spesielt avtalt.
Rekvirering
Intern rekvirering
Undersøkelsesprinsipp
Kvalitativ in-house påvisning av SARS-CoV-2 RNA varianter med sanntids polymerasekjedereaksjon (PCR).
Svar
SARS-CoV-2 variant Påvist/Ikke påvist
Svartid
1-3 dager etter påvist resultat SARS-CoV-2 RNA
Tolkning
| Svar | Tolkning |
| 501Y.V1 sannsynlig | Svaret indikerer funn av"UK variant"/B.1.1.7 |
| 501Y.V2/501Y.V3 sannsynlig | Svaret indikerer funn av"Sør-Afrika variant" eller "Brasil variant" |
| Ikke påvist | "UK variant", "Sør-Afrika variant" eller "Brasil variant" ikke funnet. Viruset tilhører en annen lineage* |
| Inkonklusivt | Analysen var ikke vellykket og det lar seg ikke avgjøre om variant foreligger heller ikke. Sannsynlig årsak er for lav virusmengde. |
*Lineage angir hvilken virusvariant som foreligger i Nextstrain/Pagolin klassifikasjonen og kan ha betydning i smitteoppsporing. For detaljer, se lenker under og foreliggende oppdatert litteratur.
Akkreditert
Analysen er ikke akkreditert
