Infeksiøs gastroenteritt kan forårsakes av virus, bakterier, parasitter eller protozoer.
Reiseanamnese og opplysninger om eventuelt utbruddsmistanke er viktig.
Virus
Norovirus gir oftest oppkast sammen med diaré og kan forårsake store utbrudd både i og utenfor helseinstitusjoner, spesielt vinterstid. Virus påvises i fæces. Oppkast kan ikke benyttes til denne analysen.
Rotavirus, adenovirus og astrovirus kan også gi utbrudd og forårsake alvorlig diaré, spesielt hos små barn.
Bakterier
Tarmpatogene bakterier kan gi diaré etter reise i sydligere strøk, men innenlands smitte forekommer også. Enteritt-asossierte E.coli, Campylobacter, Salmonella, Shigella og Yersinia er vanligst. Vibirio cholerae gir profus, vanndig diaré.
E.coli finnes i tarmens normalflora, men noen typer er assosiert med enteritt. De fire vanligste gruppene av tarmpatogene E. coli er:
Matvarer som er mistenkt å ha utløst gastroenteritt kan også undersøkes for S. aureus, Bacillus cereus og Clostridium perfringens. Slike analyser utføres eventuelt ved næringsmiddelstilsynets laboratorium.
Ved antibiotikaassosiert diaré hos innlagte pasienter bør det undersøkes på forekomst av toxinproduserende Clostridium difficile.
Parasitter
Giardia lamblia, Entamoeba histolytica og Cryptosporidium er eksempler på tarmparasitter som gjerne gir diaré, mens ved innvollsorm er vanligvis andre symptomer mer dominerende.