Soppinfeksjon ulike lokalisasjoner
Generelt om soppdiagnostikk
Laboratoriediagnostikk av soppsykdommer omfatter nukleinsyrepåvisning direkte fra prøvemateriale, direkte mikroskopi, dyrkning og eventuelt resistensundersøkelse mot antimykotika. Serologisk diagnostikk og konsentrasjonsbestemmelse av antimykotika gjøres ikke ved Akershus Universitetssykehus HF.
Rutinemessig gjøres direkte mikroskopi bare på spinalvæske.
Gjærsoppisolater fra systemisk soppinfeksjon resistensbestemmes rutinemessig mot amphotericin B, anidulafungin, flukonazol, vorikonazol og micafungin.
Hud-, hår- og negl-infeksjoner
Nukleinsyrepåvisning
| Agens/Analyser | Dermatofytter nukleinsyrepåvisning. |
| Indikasjon | Mistanke om hud-, hår- og negl-infeksjon utløst av sopp. |
| Prøvemateriale | Materiale fra hud, negler og hår. |
| Prøvetaking/forsendelse | Fra hud skrapes prøvemateriale løs med skalpell. Prøven tas fra overgangen mellom friskt og sykt vev. Prøvematerialet sendes i tørre sterile rør. Fra negl tas også prøven fra overgangen mellom friskt og sykt vev ved avskrapning med skalpell. Eventuelt fjernes deler av eller hele neglen. Prøvematerialet sendes i tørre sterile rør. Ved hårinfeksjoner sendes hår som inneholder både frisk og syk del. Prøvematerialet sendes i tørre sterile rør. |
| Oppbevaring | Dersom ikke prøvematerialet kan leveres med en gang, skal det oppbevares i kjøleskap før forsendelse til laboratoriet. |
| Undersøkelse | In house Real-time PCR mot ITS og Chitin syntase genene. Bruk av to mål-gener gjør det mulig å detektere og skille mellom Trichophyton rubrum complex,Trichophyton mentagrophytes complex,Microsporum sp og Epidermophyton sp. |
| Tolkning | Negativ/Positiv Analysen kan identifisere følgende arter: Trichophyton rubrum complex, T. mentagrophytes complex,Thrichophyton sp., Microsporum sp. og Epidermophyton sp.. |
| Svartid | Analysen vil som regel utføres ukentlig med noen unntak. Svartid vil variere fra 2-7 (14) virkedager. |
Dyrkning
| Agens/Analyser | Muggsopp dyrkning. Vi gjør i utgangspunktet kun dyrkning for å påvise sjeldne muggsopper som kan gi infeksjon i hud-, hår- og negler. Primær metode for påvisning av dermatofytter er PCR. |
| Indikasjon | Mistanke om hud-, hår- og negl infeksjon utløst av sopp. |
| Prøvemateriale | Materiale fra hud, negler og hår. |
| Prøvetaking/forsendelse | Fra hud skrapes prøvemateriale løs med skalpell. Prøven tas fra overgangen mellom friskt og sykt vev. Prøvematerialet sendes i glass uten tilsetning. Fra negl tas prøven fra overgangen mellom friskt og sykt vev ved avskrapning med skalpell.Eventuelt fjernes deler av eller hele neglen. Prøvematerialet sendes i glass uten tilsetning. Ved hårinfeksjoner sendes hår som inneholder både frisk og syk del. Prøvematerialet sendes i glass uten tilsetning. Ved pussdannende infeksjoner kan prøvemateriale sendes som puss på sterilt rør eller, ved mindre mengder, oppsamlet på vattpensel som transporteres i vanlig transportmedium. |
| Oppbevaring | Dersom ikke prøvematerialet kan leveres med en gang, skal det oppbevares i kjøleskap før forsendelse til laboratoriet. |
| Undersøkelse | Dyrkning på spesialmedier for gjærsopp og dermatofytter. |
| Tolkning | Ved oppvekst utføres ulike tilleggstester for identifikasjon for å skille for eksempel mellom ulike Trichophyton sp, Microsporum sp og Epidermophyton sp. |
| Svartid | Analysen vil utføres kun ved spesielle indikasjoner. Svartid på dyrkning er 1- 4 uker. |
| Merknader | Prøver til undersøkelse med tanke på sopp i hud-, hår- og negler vil først og fremst undersøkes ved PCR. I enkelte tilfeller vil prøven også dyrkes på ordinær måte etter utført PCR analyse. |
Slimhinneinfeksjoner og dype infeksjoner
| Agens/Analyser | Gjærsopp/Muggsopp dyrkning |
| Indikasjon | Mistanke om infeksjon utløst av sopp. |
| Prøvemateriale | Aspirat, puss, biopsier, BAL etc. |
| Prøvetaking/forsendelse | Prøvemateriale som samles forsendes i vanlig transportmedium. |
| Oppbevaring | Dersom ikke prøvematerialet kan leveres med en gang, skal det oppbevares i kjøleskap før forsendelse til laboratoriet. |
| Undersøkelse | Dyrkning på spesialmedier for gjær- og/eller muggsopp. |
| Tolkning | Ved oppvekst utføres ulike tilleggstester for identifikasjon. |
| Svartid | Prøvesvar foreligger vanligvis innen 3- 7 dager etter at prøven er mottatt. |
Sendeanalyser invasive soppinfeksjoner
Ved mistanke om invasiv/systemisk soppinfeksjon er det mulig å sende prøver til Rikshospitalet for analyse. Det må da angis på henvisningen at slik undersøkelse ønskes.
a) Muggsopp-PCR
- PCR som påviser Mucorales DNA; Lichteimia (Absidia) corymbifera, Mucor og Rhizopus arter, Rhizomucor arter.
- PCR som påviser Aspergillus sp DNA og Aspergillus fumigatus DNA.
Analysen settes opp på hverdager, og man får vanligvis svar dagen etter prøven er mottatt ved RH.
Analysen utføres ikke lørdag, søndag eller helligdager.
b) Aspergillus galaktomannan antigen
- Serum ved mistanke om systemisk infeksjon eller som ledd i overvåkning av aspergillusinfeksjon hos høyrisikopasienter.
- BAL ved mistanke om pulmonal aspergillose.
- Andre sterile prøvematerialer kan også vurderes analysert, men analysen er ikke akkreditert for dette.
c) Aspergillus presitiperende antistoff
- Klinisk og radiologisk mistanke om allergisk bronkopulmonal aspergillose (ABPA), subakutt eller kronisk aspergillose
d) Kryptokokkantigen
- Ved mistanke om kryptokokkmeningitt vil prøven settes opp til PCR ved FilmArray og dyrkers hos oss. Prøven kan sendes sendes til Rikshospitalet for kryptokokkantigen, testen kan også brukes til evaluering av behandlingsrespons.
Blodkultur
Blodkultur tas og forsendes på samme måte som ved mistanke om bakteriell infeksjon (se eget dokument).
Egen soppflaske brukes ved stor mistanke om soppinfeksjon, fordi dette mediet er noe bedre til påvisning av Candida glabrata. Det må angis på henvisningen at soppinfeksjon mistenkes.
Besvarelse
Positive svar ringes umiddelbart til rekvirent. Negative svar foreligger etter 10 dager.
Spinalvæske
Spinalvæske tas og forsendes som for undersøkelse med hensyn på bakterier (se eget dokument). Det må angis på henvisningen at soppinfeksjon mistenkes.
