FHI har referansefunksjon for enterohemorragisk E. coli (EHEC).
Karakteristisk for EHEC er tilstedeværelsen av Shigatoksin, som kodes av stx1 og stx2 (ulike subtyper) som ligger på en bakteriofag som kan mistes. I tillegg har mange EHEC genet eae, som også fins hos EPEC og hos Escherichia albertii (som kan ha stx2, vanligvis stx2f). EHEC som har mistet stx-kodende bakteriofag kalles EHEC-lst.
EHEC kan gi et bredt spekter av symptomer og kliniske tegn, se Smittvernveilederens kapittel om E. coli enteritt (inkluder EHEC-infeksjon og HUS). Det mest alvorlige bildet er kolitt og komplikasjonen hemorragisk-uremisk syndrom (HUS). Sistnevnte forekommer særlig hos barn, eldre og immunsupprimerte. Det har vært flere nasjonale utbrudd med EHEC.
EHEC-infeksjon er meldepliktig til MSIS i henhold til gitte kriterier.
Følgende førstegangsisolater av EHEC skal sendes som renkultur til FHI:
Fra 8. april 2024 gjelder at kun følgende førstegangsisolater av mistenkt EHEC-lst (EHEC som har mistet sine shigatoksin-gener) skal sendes inn:
Kriterier for innsending av E. coli blandingskulturer etter forsøk på isolering og konfirmering av virulensgen(er) er angitt i Strategirapport nr. 29, 2015 tabell 5 side 19 (kondensert her):
Kontrollprøver og isolater som påvises ved eventuelt sykdomsresidiv mindre enn 3 måneder etter siste positive prøve skal ikke sendes inn med mindre det foreligger grunn til å mistenke ny EHEC-infeksjon.
Alle innsendte EHEC-isolater verifiseres spektrofotometrisk (MALDI-TOF MS) og stx2 subtypes ved PCR. Høyvirulente EHEC (stx2a, stx2c, stx2d) undersøkes med molekylær serotyping (PCR) og multilokus VNTR analyse (MLVA).
Innsendte blandingskulturer analyseres for å kartlegge sentrale virulensgener (real-time PCR) og stx2 subtypes (PCR).
Helgenomsekvensering av E. coli isolater inklusive EHEC utføres for å kartlegge virulensgener, serotype [1], sekvenstype (ST) [2] og klustertype (CT) [3] med tanke på molekylærepidemiologisk overvåking inklusive utbruddsdeteksjon. De nye stx2 subtypene (stx2g-m [4]) er inkludert i In-house pipelinen.
For analyser av mistenkt EHEC-lst, se EPEC-kapittelet.
Isolater (evt. blandingskultur) fryses og oppbevares i minst 10 år.
For renkultur med stx2 bærende EHEC sendes det ut midlertidig svar med PCR-resultater for stx2 subtype og evt. serotype. Etter gjennomført helgenomsekvensering sendes endelig svar.
For blandingskultur med stx2 sendes endelig svar etter PCR.
Analysesvar ledsages av klinisk relevante kommentarer der det anses som nødvendig for oppfølgingen av den enkelte pasient.
Ved påvisning av høyvirulente EHEC (stx2a, stx2c og/eller stx2d) kontaktes kommuneoverlege for vurdering av smitteverntiltak rundt enkelttilfellet.
Det gjøres løpende overvåkning med tanke på deteksjon av utbrudd. Sekvenstype og klustertype angis for hvert EHEC-isolat. Smitteoppfølgingen ved utbrudd gjennomføres via kommuneoverlege i den aktuelle kommunen.
Faglig ansvarlig (metodeteknisk overordnet ansvar):
Medisinsk-faglig anvarlig (kliniske vurderinger, forsvarlighet ihh helselovgivningen)
Fra og med januar 2021 ble alle EHEC med stx1 vurdert som lavvirulente, uavhengig av stx1 subtype.
Per 8. mai 2023 avsluttet FHI analyse av EHEC renkultur som kun bærer stx1 (uten stx2). Unntak er ved mistanke eller påvist HUS. Dette pga. redusert budsjett ved FHI. EHEC med stx1 (uten stx2) vurderes som lavvirulent.
Per 8. april 2024 ble kriteriene for sending og (MSIS melding) for eae alene E. coli endret til kun å gjelde ved påvist eller mistenkt HUS, eller ved smitteoppsporing rundt HUS-tifelle.
Smittevernveilederen: E. coli enteritt (inkludert EHEC-infeksjon og HUS
Smittevernveilederen: Oppfølging ved tarminfeksjoner av personer i smittefaregrupper
Strategirapport 2015 Bakterologisk fecesdiagnostikk
EHEC-infeksjon overvåkes på EU og EØS-nivå av ECDC: https://www.ecdc.europa.eu/en/shiga-toxin-producing-escherichia-coli-stec
1. In-house pipeline: https://github.com/garcia-nacho/TOP
2. Wirth T, Falush D, Lan R, Colles F, Mensa P, Wieler LH, Karch H, Reeves PR, Maiden MC, Ochman H, Achtman M. (2006). Sex and virulence in Escherichia coli: an evolutionary perspective. Mol Microbiol. 60(5):1136-51. (http://enterobase.warwick.ac.uk/species/index/ecoli).
3. Enterobase (http://enterobase.warwick.ac.uk) Escherichia/Shigella skjema v1, kjørt i Ridom SeqSphere+.
4. Bai, Xiangning, Flemming Scheutz, Henrik Mellström Dahlgren, Ingela Hedenström, and Cecilia Jernberg. 2021. Characterization of Clinical Escherichia coli Strains Producing a Novel Shiga Toxin 2 Subtype in Sweden and Denmark. Microorganisms 9, no. 11: 2374.