Enterohemoragisk E. coli (EHEC)

Sist oppdatert: 30.10.2024
Utgiver: Folkehelseinstituttet
Versjon: 2.2
Kopier lenke til dette emnet
Foreslå endringer/gi kommentarer

Innledning 

FHI har referansefunksjon for enterohemorragisk E. coli (EHEC).

Karakteristisk for EHEC er tilstedeværelsen av Shigatoksin, som kodes av stx1 og stx2 (ulike subtyper) som ligger på en bakteriofag som kan mistes. I tillegg har mange EHEC genet eae, som også fins hos EPEC og hos Escherichia albertii (som kan ha stx2, vanligvis stx2f). EHEC som har mistet stx-kodende bakteriofag kalles EHEC-lst.

 

EHEC kan gi et bredt spekter av symptomer og kliniske tegn, se Smittvernveilederens kapittel om E. coli enteritt (inkluder EHEC-infeksjon og HUS). Det mest alvorlige bildet er kolitt og komplikasjonen hemorragisk-uremisk syndrom (HUS). Sistnevnte forekommer særlig hos barn, eldre og immunsupprimerte. Det har vært flere nasjonale utbrudd med EHEC.

EHEC-infeksjon er meldepliktig til MSIS i henhold til gitte kriterier.

Indikasjon  

  • Pasientrettet: differensiering i høyvirulente og lavvirulente EHEC med tanke på oppfølging (økt oppmerksomhet for HUS-utvikling) og smittevern rundt enkeltpasienter. Samt korrekt diagnose i forhold til aktuelle differensialdiagnoser.
  • Folkehelserettet: Utbruddsovervåkning- og etterforskning

Innsendingsplikt 

Følgende førstegangsisolater av EHEC skal sendes som renkultur til FHI:

  • ved påvist eller mistenkt HUS: EHEC - uavhengig av bakteriens virulensprofil
  • ved diaré, inklusive blodig:
    • EHEC med stx2 alene eller i kombinasjon med stx1
    • EHEC hvor man på primærlaboratoriet ikke klarer å skille mellom stx1 og stx2

 

Fra 8. april 2024 gjelder at kun følgende førstegangsisolater av mistenkt EHEC-lst (EHEC som har mistet sine shigatoksin-gener) skal sendes inn:

  • eae-alene E. coli ved påvist mistenkt/mistenkt HUS
  • eae-alene E. coli ved ved smitteoppsporing rundt HUS-tilfelle

 

Kriterier for innsending av E. coli blandingskulturer etter forsøk på isolering og konfirmering av virulensgen(er) er angitt i Strategirapport nr. 29, 2015 tabell 5 side 19 (kondensert her):

  • ved mistenkt eller påvist HUS:
    • stx1 og/eller stx2
    • unntaksvis ved eae alene, da etter avtale
  • ved diaré: stx2

 

Kontrollprøver og isolater som påvises ved eventuelt sykdomsresidiv mindre enn 3 måneder etter siste positive prøve skal ikke sendes inn med mindre det foreligger grunn til å mistenke ny EHEC-infeksjon.

Prøvemateriale 

  • Renkultur av bakterieprøver
  • Blandingskulturer av EHEC og mistanke om EHEC-lst (se aktuelle settinger over): hvis det ikke lykkes å bekrefte funn av virulensgen(er) etter spredning av 5-10 kolonier av E. coli.

Analyser  

Alle innsendte EHEC-isolater verifiseres spektrofotometrisk (MALDI-TOF MS) og stx2 subtypes ved PCR. Høyvirulente EHEC (stx2a, stx2c, stx2d) undersøkes med molekylær serotyping (PCR) og multilokus VNTR analyse (MLVA).

 

Innsendte blandingskulturer analyseres for å kartlegge sentrale virulensgener (real-time PCR) og stx2 subtypes (PCR).

 

Helgenomsekvensering av E. coli isolater inklusive EHEC utføres for å kartlegge virulensgener, serotype [1], sekvenstype (ST) [2] og klustertype (CT) [3] med tanke på molekylærepidemiologisk overvåking inklusive utbruddsdeteksjon. De nye stx2 subtypene (stx2g-m [4]) er inkludert i In-house pipelinen.

 

 

For analyser av mistenkt EHEC-lst, se EPEC-kapittelet.

Stammebank 

Isolater (evt. blandingskultur) fryses og oppbevares i minst 10 år.

Prøvesvar  

For renkultur med stx2 bærende EHEC sendes det ut midlertidig svar med PCR-resultater for stx2 subtype og evt. serotype. Etter gjennomført helgenomsekvensering sendes endelig svar.

 

For blandingskultur med stx2 sendes endelig svar etter PCR.

Svartid 

  • Midlertidig svar stx2 subtyping med evt. ekstraanalyser: 2-4 virkedager + forsendelse (prøve til FHI, prøvesvar i post)
  • Endelig svar:
    • høyvirulente EHEC: ca. 2 uker fra mottak
    • andre EHEC: ca. 3 uker fra mottak

Tolkning  

Analysesvar ledsages av klinisk relevante kommentarer der det anses som nødvendig for oppfølgingen av den enkelte pasient.

 

Ved påvisning av høyvirulente EHEC (stx2a, stx2c og/eller stx2d) kontaktes kommuneoverlege for vurdering av smitteverntiltak rundt enkelttilfellet.

 

Det gjøres løpende overvåkning med tanke på deteksjon av utbrudd. Sekvenstype og klustertype angis for hvert EHEC-isolat. Smitteoppfølgingen ved utbrudd gjennomføres via kommuneoverlege i den aktuelle kommunen.

Fagansvarlige  

Faglig ansvarlig (metodeteknisk overordnet ansvar):

 

Medisinsk-faglig anvarlig (kliniske vurderinger, forsvarlighet ihh helselovgivningen)

Endringshistorikk 

Fra og med januar 2021 ble alle EHEC med stx1 vurdert som lavvirulente, uavhengig av stx1 subtype.

 

Per 8. mai 2023 avsluttet FHI analyse av EHEC renkultur som kun bærer stx1 (uten stx2). Unntak er ved mistanke eller påvist HUS. Dette pga. redusert budsjett ved FHI. EHEC med stx1 (uten stx2) vurderes som lavvirulent.

 

Per 8. april 2024 ble kriteriene for sending og (MSIS melding) for eae alene E. coli endret til kun å gjelde ved påvist eller mistenkt HUS, eller ved smitteoppsporing rundt HUS-tifelle.

Nyttige lenker 

Referanser 

1. In-house pipeline: https://github.com/garcia-nacho/TOP

2. Wirth T, Falush D, Lan R, Colles F, Mensa P, Wieler LH, Karch H, Reeves PR, Maiden MC, Ochman H, Achtman M. (2006). Sex and virulence in Escherichia coli: an evolutionary perspective. Mol Microbiol. 60(5):1136-51. (http://enterobase.warwick.ac.uk/species/index/ecoli).

3. Enterobase (http://enterobase.warwick.ac.uk) Escherichia/Shigella skjema v1, kjørt i Ridom SeqSphere+.

4. Bai, Xiangning, Flemming Scheutz, Henrik Mellström Dahlgren, Ingela Hedenström, and Cecilia Jernberg. 2021. Characterization of Clinical Escherichia coli Strains Producing a Novel Shiga Toxin 2 Subtype in Sweden and Denmark. Microorganisms 9, no. 11: 2374.