En del laboratorier har gått over til PCR-påvisning av vanlige tarmpatogene agens som primærundersøkelse ved mistanke om infeksiøs gastroenteritt. Hvilke agens som analyseres varierer noe mellom de forskjellige laboratoriene avhengig av hvilken test de bruker.

Vanligste inkluderte agens inkluderer:

• Bakterier
• Yersinia enterocolitica
• Salmonella spp.
• Campylobacter spp.
• Shigella spp./EIEC 
• EHEC
•  Parasitter
  • Cryptosporidium spp
  • Giardia lamblia
  • Entamoeba histolytica
• Virus (se egne analyser)
  • Norovirus RNA
  • Rotavirus RNA
  • Adenovirus DNA (fæces)
  • (Astrovirus)

*Positive funn av bakterier kan bli dyrket for typing og eventuell resistensbestemmelse .

I spesielle situasjoner hvor andre bakterier kan være årsak til pasientens symptomer, vil i tillegg spesialdyrkning kunne utføres. Det er derfor avgjørende at gode kliniske opplysninger er angitt!

• Fæcesprøver uten tilsetning eller i flytende bakt-transportmedium (flytende amies med flocket swab og flytende Cary Blair) ved at penselen dyppes i avføringen.
• Tarmbiopsi i steril universalcontainer med litt saltvann.
• Abscessinnhold, duodenalaspirat i steril universalcontainer uten tilsetning.

Se Fæcesprøver under kapittelet Prøvetaking.

• Må sendes i transporthylse av hardplast på grunn av smittefare.
• Bør oppbevares i kjøleskap og undersøkes innen 3 døgn etter prøvetakning.

Kvalitativ påvisning av de beskrevne gastroenteritt-agens ved hjelp av sanntids polymerasereaksjon (PCR).

Påvist / Ikke påvist for hver enkel analyse

Følgende tilstander er nominativt meldipliktige til MSIS (Gruppe A)

• Campylobacteriose
• Cryptosporidium-infeksjon
• Enteropatogen E. coli-enteritt
• Giardiasis
• Paratyfoidfeber
• Salmonellose
• Shigellose
• Tyfoidfeber
• Yersiniose

Se også MSIS meldepliktige sykdommer for komplett oversikt.

Opplysning om smittested er viktig med tanke på å oppdage innenlands matbårne utbrudd så tidlig som mulig.

• Strategirapport nr 29 feces-bakteriologi.pdf
• Strategimøte 2005-Virale gastroenteritter.pdf
• Strategimøte 2014 Fæcesparasittologi.pdf
• Meldesystem for smittsomme sykdommer (MSIS)