Hovedgenmørkøren for EPEC er eae. Typiske EPEC (tEPEC) har i tillegg genene bfpA og bfpB som bidrar i kodingen av Bundle Forming Protein. EPEC som bare har eae, kalles atypiske EPEC (aEPEC). eae-genet fins også hos EHEC og hos Escherichia albertii.

Folkehelseinstituttet har medisinsk mikrobiologisk referansefunksjon for tarmpatogene E. coli, inklusive EPEC. For forekomst, inkubasjonstid, klinikk etc. se SMITTEVERNVEILEDERENs kapittel om E. coli enteritt. EPEC-infeksjon er meldepliktig til MSIS etter gitte kriterier.

• PASIENTRETTET: Korrekt diagnose (ICD-10 A04.0 Infeksjon som skyldes enteropatogen E. coli vs. aktuelle differensialdiagnoser) og evt. smitteverntiltak rundt pasienten
• FOLKEHELSERETET: nasjonal epidemiologisk overvåkning inklusive utbruddsdeteksjon- og etterforskning.

Fra 8. april 2024 skal innsending av eae-positive E. coli kun skje ved hemolytisk uremisk syndrom (HUS), ved mistanke om HUS, eller ved smitteoppsporing rundt et HUS-tilfelle. Kun unntaksvis kan blandingskultur av eae-positiv E. coli innsendes, da etter avtale.

Ved funn av markør for tEPEC og isolering av sannsynlig tEPEC skal isolatet sendes til FHI for verdifisering og karakterisering.

Renkultur av eae alene positiv E. coli eller av sannsynlig tEPEC.

• Mikrobiologiske rekvisisjoner FHI: Skjemaer samleside
• Innsending av prøver til mikrobiologiske undersøkelser
• Praktisk veiledning: prøvemengde, medium, kjøling og pakking

For en foreløpig differensiering mellom EHEC-lst og aEPEC utføres PCR:

• molekylær serotyping
• hvis O26 utføres analyse for espK (markør på EHEC-lst hos O26)
• evt. E. coli MLVA

Helgenomsekvensering er hovedanalysen.

Som støtte for foreløpig differensiering i aPEC eller EHEC-lst og støtte for utbruddsdeteksjon, utføres E. coli MLVA.

Helgenomsekvensering av EPEC utføres på samme måte som NGS for tarmpatogene E. coli.

Ved utbrudd med tEPEC utføres evt. MLVA i påvente av NGS.

Isolater fryses og oppbevares i minst 10 år.

• For eae alene prøver ved HUS, mistanke om HUS eller ved smitteoppsporing rundt HUS: Midlertidig svar vil kommuniseres ved funn av espK positive O26 med eae (sannsynlig EHEC-lst), mens endelig svar vil komme etter ca 2 uker da med differensiering i aEPEC eller EHEC-lst (espK+ O26 isolat og/eller clustring med høyvirulent EHEC).

• For tEPEC: Endelig svar normalt ca. 3 uker fra mottat isolat. Ved utbrudd kan svartiden være kortere.

Analyser av tarmpatogene E. coli er ikke akkreditert, men kvalitetskontrollert i henhold til ISO 17025 (Prøvings- og kalibreringslaboratorier).

Fra 8. april 2024 er kriteriene for innsending (og melding til MSIS) endret til kun å gjelde eae alene positiv E. coli ved påvist eller mistanke om HUS, eller ved smitteoppsporing rundt HUS-tilfelle.

Faglig ansvarlig (overordnet metodeansvar)

• Lin C. T. Brandal (NGS, PCR)
• Mohammed Umaer Naseer (NGS, PCR)
• Polina Katsiouleri (fenotypi)

Medisinsk-faglig ansvarlig (kliniske vurderinger, forsvarlighet iht helselovgivningen)

• Polina Katsiouleri

SMITTEVERNVEILEDERENs kapittel om oppfølging ogs kontroll av personersom som håndterer næringsmidler.