UGT1A1 genotype

• Moderat forhøyet bilirubinverdi eller mistanke om familiær, mild hyperbilirubinemia (Gilberts syndrom).
• Påvise eller utelukke UGT1A1-genvarianter som påvirker glukuronideringskapasiteten av legemidler (irinotekan).

Pasientforberedelse

Ingen

Prøvetaking

• Materiale: EDTA-fullblod.
• Minste prøvevolum: 0.5 ml (helst 1 ml) fullblod.

Holdbarhet

• Oppbevaring: Prøven er holdbar flere døgn i romtemperatur, men oppbevaring i kjøleskap anbefales. Ved lengre tids lagring ( >1 mnd) bør prøven fryses.
• Forsendelse: Ordinær post, kan sendes ved romtemperatur.

Rekvisisjon

Medisinsk biokjemi og farmakologi.

Ikke relevant

Avdeling for medisinsk biokjemi, Ullevål

Vanligvis innen 2 uker, ta kontakt dersom det haster mer.

Forekomsten av UGT1A1-genvarianter er forskjellig mellom ulike folkegrupper.

Frekvens av UGT1A1-genvarianter (allelfrekvens):

(TA) ₆: ca 60% blant nordeuropeere, 50% hos afrikanere og 90% hos asiatere

(TA) ₇: ca 35% blant nordeuropeere, 35% hos afrikanere og < 1% hos asiatere

(TA) ₈: ca 0-1% blant nordeuropeere og asiatere, 10% hos afrikanere

(TA) ₅: ca 0-1% blant nordeuropeere og asiatere, 5% hos afrikanere

Enzymet UDP-glukuronosyltransferase 1A1 (UGT1A1) bidrar til glukuronidering og metabolisering av en rekke små, lipofile komponenter blant annet bilirubin og enkelte cytostatika. Det er stor forskjell i UGT1A1-aktivitet mellom individer, og enzymaktiviteten er i stor grad genetisk betinget. Sekvensvariasjon i UGT1A1-genets regulerende område kan føre til både redusert og økt enzymmengde, med påfølgende varierende glukuronideringskapasitet og toksiske reaksjoner. Blandt nordeuropeere er den vanligste UGT1A1-varianten seks repeterende TA-enheter (TA)₆. Økning av de repeterende enheter til (TA)₇ eller (TA)₈ fører til en betydelig redusert enzymmengde, mens en reduksjon til (TA)₅ øker enzymaktiviteten. Genotyping av UGT1A1 kan bidra til å forklare årsaken til moderat økte bilirubinverdier (Gilberts syndrom) og alvorlige bivirkninger som toksiske serumkonsentrasjoner og neutropeni ved bruk av medikamentet irinotekan.

Svarrapportering

UGT1A1-genotype rapporteres basert på det samlede resultat etter analyse av sekvensvarianten UGT1A1 LRG_733:g.4963TA , hvor antallet TA-repetisjoner (TA)_n fremkommer (n=5-8). Allelkombinasjoner med innhold av 6 og 7 TA-repetisjoner dominerer, men (TA)₅ og (TA)₈-varianter vil også identifiseres.

Genotypevarianter:

UGT1A1*28: Allelkombinasjoner med (TA)₆ og (TA)₇ : (TA)_6/6 (homozygot), (TA)_6/7 (heterozygot) og (TA)_7/7 (homozygot)

UGT1A1*37: Allelkombinasjoner der (TA)₈ inngår

UGT1A1*36: Allelkombinasjoner der (TA)₅ inngår

Svartolkning

Normal enzymmengde: (TA)_6/6

Moderat redusert enzymmengde: (TA)_6/7, (TA)_6/8

Redusert enzymmengde: (TA)_7/7, (TA)_8/8

Normal til økende enzymmengde: (TA)_5/5

Usikkerhet

Pasientens genotype er i utgangspunktet stabil og uendret gjennom hele livet. Det er således normalt ikke indisert å gjenta en genotyping hvis den er utført tidligere og svaret er tilgjengelig for rapportering.
Unntak kan være:

• Ønske om ny genotyping med en mer omfattende metode:
  Hvis man tidligere bare har fått undersøkt én eller noen få DNA-sekvensvarianter i det aktuelle genet, kan det være aktuelt å teste påny med en ny eller mer omfattende metode som fanger opp flere varianter.
• Pasienten er transplantert:
  Stamcelletransplantasjon tilfører donorleukocytter, noe som vil gi endret genotype ved analysering av blodprøve. Organtransplantasjon tilfører organ med donors genotype. Blodceller og øvrige vev er da uendret.
• Mistanke om feil:
  Selv om det er sjelden, kan det forekomme berettiget mistanke om feil genotyperesultat. I så fall kan ny genotyping være indisert. I tillegg til prøveforbytning eller feil knyttet til analysering eller rapportering, kan det ved leukopeni i forbindelse med graviditet eller hos personer som får ordinær blodoverføring (én enhet SAG-blod kan inneholde inntil 1 million leukocytter) forekomme at det i en periode på inntil noen måneder blir en tilblanding og proliferasjon av fosters eller blodgivers leukocytter (mikrokimerisme) som kan gi endret genotyperesultat.
• Klonal ekspansjon av mutert cellelinje hos pasienten.

Ullevål

Pyrosekvensering vha PyroMark Q24 (Qiagen) instrument.

Analysen omfatter undersøkelse av følgende sekvensvariant (allel) i UGT1A1-genet lokalisert til kromosom 2:

• UGT1A1 (TA)5/6/7/8: LRG_733:g.4963TA (rs8175347)