FHI har referansefunksjon for Salmonella. Påvisning av Salmonella i klinisk prøvemateriale er meldingspliktig til MSIS.

I tillegg til analyser på enkelt-isolater, bidrar referansefunksjonen til nasjonal epidemiologisk overvåking, utbruddsetterforskning, forebygging og bekjempelse av Salmonella mage-tarminfeksjoner.

For omtale av smittemåte, inkubasjonstid og sykdommer som bakterien forårsaker, se lenker lenger ned.

• PASIENTRETTET: Species og serovar bestemmelse for korrekt diagnose og smittevern for enkeltpasienmter
• FOLKEHELSERETTET: Utbruddsovervåkning og overvåkning av antibiotikaresistens.

Alle kliniske førstegangsisolater av Salmonella sendes som renkultur til FHI. Isolater som påvises ved eventuelt sykdomsresidiv mindre enn 3 måneder etter siste positive prøve skal ikke sendes inn med mindre det foreligger grunn til å mistenke reinfeksjon. Dersom Salmonella isoleres fra ulike prøvematerialer (for eksempel feces, blod eller urin), bør førstegangsisolatet fra «det klinisk mest alvorlige» materialet sendes inn.

• Renkultur av bakterieprøver

Alle prøver skal sendes inn sammen med utfylt rekvisisjonsskjema.

• Innsending av prøver til mikrobiologiske undersøkelser
• Praktisk veiledning: prøvemengde, medium, kjøling og pakking

• Alle innsendte Salmonella-isolater verifiseres spektrofotometrisk (MALDI-TOF MS) og undersøkes serologisk for tyfoide Salmonella. I tillegg benyttes en PCR for påvisning av d-tartrat (som skiller S. Paratyphi B fra S. Paratyphi B Java).
• I utbruddsituasjon benyttes evt. MLVA for å sannsynliggjøre tilhørighet til utbrudd.
• Helgenomsekvensering benyttes til å bestemme serovar, sekvenstype (ST) og klustertype (CT), det siste for påvisning av utbrudd.
• Antibiotikaresistens bestemmes i overvåkningsøyemed, og resultater publiseres i NORM-rapporten og rapporter fra ECDC og WHO (GLASS).

Agglutinering utføres mot utvalgte O- og H antisera fra SIFIN.

• Ha, Hb, Hd
• O2, O4, O9, Vi

Hvis agglutinering ikke kan utelukke S. Paratyphi B/ S. Paratyphi B variant Java, utføres d-tartrat PCR.

I utbruddssituasjon kan evt. MLVA benyttes for å sannsynliggjøre tilhørighet til utbrudd i påvente av NGS.

Helgenomsekvensering påviser sekvenstype (ST) ved multilokus sekvenstyping (MLST) [1] og clustertype (CT) ved kjernegenom MLST [2] i Ridom SeqSphere+.

Resistenstesting av Salmonella gjøres primært for rapportering til NORM:

1. fenotypisk AMR-testing med lappediffusjon i henhold til EUCAST protokoll for

1. invasive isolater
2. innenlandssmittede og smitte ikke angitt
3. S. Typhimurium (inklusive monofasisk variant) uavhengig av smittested
4. alle S. Typhi og S. Paratyphi A eller B uavhengig av prøvemateriale

2. Genotypiske resultater basert på bioinformatisk analyse med AMRFinderPlus.

Invasive isolater svares ut midlertidig om tyfoide serovarianeter kan utelukkes, det samme med non-invasive isolater hvor primærlaboratoriet eller ref.lab sin agglutinering ikke kan utelukke S. Typhi eller S. Paratyphi A eller B.

Endlige svar sendes når helgenomresultat foreligger. Prøven svares ut med serovar, sekvenstype (ST) og clustertype (CT).

Telefonisk beskjed gis ved agglutingeringsfunn som sannsynliggjør typfoid Salmonella, hvor innsendende laboratorium ikka har hatt mistanke om dette.

Midlertidig svar sendes vanligvis innen 2-3 arbeidsdager etter at prøven er mottatt. Forsinkelser kan forekomme.

Endelig svar for invasive isolater og agglutineringsresultater som ikke kan utelukke S. Typhi eller S. Paratyphi A eller B sendes vanligvis ut ca 2 uker etter at prøven er mottatt, mens andre Salmonella svares endelig ut etter ca 3 uker etter mottak.

Salmonella-analysene er ikke akkreditert, men kvalitetskontrollert i henhold til ISO 17025 (Prøving- og kalibreringslaboratorier).

Alle Salmonella-isolater fryses og oppbevares i minst 10 år.

Faglig ansvarlig (overordnet metodeansvar)

• Mohammed Umaer Naseer
• Lin Cathrine T. Brandal
• Polina Katsiouleri (fenotypi)

Medisinsk-faglig ansvarlig (klinisk tolkning, forsvarlighet iht helselovgivningen)

• Polina Katsiouleri

SMITTEVERNVEILEDER for helsepersonell

- salmonellose

- tyfoidfeber

- paratyfoidfeber

- oppfølging og kontroll av personer som håndterer næringmidler

VAKSINEVEILEDER for helsepersonell: tyfoidvaksine

ECDC temaside om salmonellose https://www.ecdc.europa.eu/en/salmonellosis.

ECDC sitt Food-and Waterborne Network, hvor representanter fra referanselaboratoriet deltar.

EU/EØS rapporter hvor norske data på Campylobacter inngår:

• ECDC: https://www.ecdc.europa.eu/en/campylobacteriosis/surveillance
• EMA nettside for JIACRA (Joint-interagency antimicrobial consumption and resistance analysis) rapporter: https://www.ema.europa.eu/en/veterinary-regulatory-overview/antimicrobial-resistance-veterinary-medicine/analysis-antimicrobial-consumption-resistance-jiacra-reports