Analyser som begynner på ...
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
Æ
Ø
Å

KRAS

Sist oppdatert: 04.02.2024
Forfattere: Geir Kongelf, Eva Smedsrud
Utgiver: Oslo universitetssykehus
Versjon: 1.2
For tilgang til tidligere versjoner, kontakt redaktøren.
Kopier lenke til dette emnet
Foreslå endringer/gi kommentarer

Viktig informasjon 

  • Denne testen utføres med IdyllaTM KRAS Mutation Test fra Biocartis og vil ikke kunne detektere alle klinisk signfikante varianter.
  • KRAS kan også inngå i en analysepakke på HTS som vil kunne påvise ytterligere varianter.

Prøvemateriale 

Formalinfiksert, parafininnstøpt (FFPE) vev.

Patologilaboratoriene behøver ikke å sende fra seg parafinblokker. DNA isoleres fra snitt montert på objektglass. Innsendt snitt vil ikke bli returnert.

 

HE-farget snitt + 4 stk. 10μm ufargede snitt montert på objektglass (evt. blokk, dersom det ikke er mulighet for å lage snitt). Minimum 10% neoplastiske celler.

Forventet svartid 

Forventet svartid er innen 7 virkedager.

Undersøkelsesprinsipp 

Idylla™ KRAS Mutation Test er en fullautomatisert, multipleks PCR-test som utføres på Biocartis Idylla™-systemet.

Svar 

Resultatet rapporteres som:

  • Variant påvist (med beskrivelse av hvilken variant som ble påvist).
  • Varianter ikke påvist.
  • Inkonklusiv

Tolkning 

En internkontroll tester for mengde amplifiserbar DNA i prøven. Idylla software tolker signalene fra PCR-reaksjonen i internkontrollen og pasientprøven og avgjør genotype ved å beregne forskjellen mellom KRAS-kontrollens Cq og Cq som ble oppnådd for variantsignaler.

 

IdyllaTM kan påvise følgende varianter i KRAS:

 

Ekson 2: G12A, G12C, G12D, G12R, G12S, G12V, G13D

Ekson 3: A59T/E/G, Q61H, Q61K, Q61L/R

Ekson 4: K117N, A146P/T/V

Måleusikkerhet 

  • Metoden er validert med FFPE fra vev med opphav fra kolorektal tumor.
  • Bruk av prøver som ikke oppfyller kriterier for mengde vev, amplifiserbart DNA og andel neoplastiske celler kan medføre upålitelig eller ugyldige resultat.
  • Ved heterogenitet av prøver eller flere varianter, rapporteres kun den påviste dominante varianten.
  • Idylla™ KRAS Mutation Test kan påvise allelefrekvenser ≥ 5 %.

 

  • 3 sjeldent forekommende varianter (G12D (c.35_36delinsAC), G12V (c.35_36delinsTC) og Q61R (c.182_183delinsGT)) vil ikke bli påvist med denne testen.

  • Mutasjon G12W (c.34_36delinsTGG) kan påvises og rapporteres som G12C, og mutasjonene G13N (c.37_38delinsAA) og G13E (c.38_39delinsAA eller c.38_39delinsAG) vil resultere i en G13D-annotering.
Fant du det du lette etter?
Ja
Nei
Så bra. Fortell oss gjerne hva du var fornøyd med.
Vi kan ikke svare deg på tilbakemeldingen din, men bruker den til å forbedre innholdet. Vi ber om at du ikke deler person- eller helseopplysninger.
Send
Kan du fortelle oss hva du var ute etter?
Vi kan ikke svare deg på tilbakemeldingen din, men bruker den til å forbedre innholdet. Vi ber om at du ikke deler person- eller helseopplysninger.
Send