Screening for kritiske varianter utføres på et utvalg av luftveisprøver med påvist SARS-CoV-2.
Følgende kritiske varianter (Variants of Concern -VoC) blir undersøkt (WHO/Pangolin klassifikasjon):
I tillegg utføres helgenomsekvensering for endelig typebestemmelse.
Intern rekvirering.
Ved spesifikt ønske om variantanalyse*, vennligst ta telefonisk kontakt på 22 11 82 01 (mandag til fredag 0800-1600) eller 22 11 88 45 (helg/helligdag).
*kun for inneliggende pasienter der svaret har terapeutisk konsekvens
Kvalitativ in-house påvisning av SARS-CoV-2 RNA varianter med sanntids polymerasekjedereaksjon (PCR).
Prosjektenhet for SARS-CoV-2 RNA påvisning (PCR), Ullevål.
SARS-CoV-2 variant Påvist/Ikke påvist/Inkonklusivt
1-3 dager etter påvist resultat SARS-CoV-2 RNA.
Svar på ønsket analyse som meldes før kl 12 på hverdager, kommer vanligvis innen kl 16 samme dag.
Svar | Tolkning |
Variant påvist | Svaret indikerer sannsynlig funn av angitt variant. |
Ikke påvist | Omikron variant ikke funnet. Viruset tilhører en annen lineage* |
Inkonklusivt | Analysen var ikke vellykket og det lar seg ikke avgjøre om variant foreligger heller ikke. Sannsynlig årsak er for lav virusmengde i prøven. |
*Lineage angir hvilken virusvariant som foreligger i Nextstrain/Pagolin klassifikasjonen og kan ha betydning i smitteoppsporing. For detaljer, se lenker under og foreliggende oppdatert litteratur.
Analysen er ikke akkreditert