MSI (Mikrosatelitt instabilitet)

Mikrosatelitt instabilitet (MSI) er en av de fremste molekylære markørene ved kolorektal kreft (CRC), men er også viktig ved ovariekreft, endometriekreft og andre gastrointestinale kreftformer som f.eks. ventrikkelkreft. Nylig er MSI påvist å være til stede i nesten alle undersøkte tumorer, selv om prevalensen ofte er lav (Le et al. (2017) Science 10.1126/science.aan6733.). MSI er en veletablert markør som er assosiert med Lynch syndrom (som forekommer hos ca. 20 % av CRC pasienter med MSI), samt somatisk ervervet MSI som forekommer hos ca. 80 % av CRC-pasienter med MSI, som viser en god prognose siden tumorene er bedre immunkontrollert. Nylig er MSI påvist å være assosiert med Lynch syndrom i et mye bredere utvalg tumorer enn det man antok tidligere, inkludert uroteliale, prostata-, pankreas-, adrenokortikale, tynntarm-, sarkom, mesoteliom, melanom, ventrikkel- og germinalcelletumorer (Latham et al. (2018) J Clin Oncol 36, 1-9. 10.1200/JCO. 18.00283.). MSI har også en prediktiv rolle i stadium II kolonkreft: disse kreftformene er påvist å respondere dårligere på 5-fluorouracil (5-FU)-basert adjuvant kjemoterapi. Nylig er MSI blitt assosiert med tumorens samlede mutasjonsbelastning og tilstedeværelse og omfang av insersjoner og delesjoner, neoantigenbelastning og lymfocyttinfiltrasjon i tumoren, og er påvist å være prediktiv for respons på immunterapier, for eksempel anti-PD-1 i en pan-kreftsituasjon (Le et al. (2017) Science 10.1126/ science. aan6733.).

Gjeldende internasjonale retningslinjer angir at tumorvevstesting for MMR-mangel med immunhistokjemi for MMR-proteiner og/eller MSI skal vurderes hos alle CRC-pasienter. Selv om tap av MMR-proteinimmunreaktivitet som regel er påvist ved MMR CRC, er normal immunreaktivitet også observert i dMMR-tilfeller. MSI DNA-testing kan derfor utføres enten trinnvis eller samtidig (Sepulveda et al. (2017) Archives of Pathology & Laboratory Medicine: May 2017, Vol. 141, No. 5, pp.625-657.).

MSI er definert som endringer i lengdene av mikrosatelitter grunnet delesjon eller insersjon av gjentatte enheter for å produsere nye allellengder i tumor-DNA sammenlignet med normalt/germinalcelle-DNA fra samme individ. Mikrosatelittene finnes både i kodende og ikke-kodende områder i genomet.

Mismatch repair (MMR) systemet består av flere gener som koder for proteiner som MLH1/PMS2, MSH2/MSH6. MMR-systemets funksjon er å oppdage og korrigere feil-innsetting av baser som oppstår ved celledeling. Et defekt MMR-system vil føre til mikrosatelitt instabilitet (MSI).

Formalinfiksert parafininnstøpt tumorvev (FFPE).

Preparatene vurderes av patolog for å finne egnet område/blokk for FFPE-snitt til analysen. Andel av neoplastiske celler (i prosent) i tumorpreparatet angis på rekvisisjon.

For å bestemme MSI-status brukes Idylla™ MSI Test fra Biocartis.

Testen er en in vitro diagnostisk test som er beregnet for kvalitativ deteksjon av et panel med 7 monomorfe biomarkører for identifisering av kolorektal kreft med mikrosatelittinstabilitet (MSI). Idylla™ MSI Test bruker FFPE vevssnitt fra humant kolorektalt kreftvev (CRC), der nukleinsyrer blir frigjort og deretter analysert ved hjelp av PCR-amplifisering og høyoppløselig smeltepunkts analyse.

Idylla™ MSI Test er et helautomatisert kassettbasert analysesystem, fra FFPE-prøveklargjøring til rapportering av MSI-status. Hver test har en integrert prosesskontroll for å kontrollere prosessen fra start til svarrapportering.itt kan benyttes.

En total vurdering av testens 7 biomarkører og prøvens kvalitetsscore angir resultat. Svar blir utgitt som MSI (Mikrosatelitt instabilitet) POSITIV, NEGATIV eller INKONKLUSIV.

MSI (Mikrosatelitt instabilitet) POSITIV. Mikrosatelitt instabil fenotype (MSI-H), funn i to/flere av de 7 undersøkte markørene.

• En MSI-H status for en prøve blir angitt hvis det er påvist endringer i to eller flere av de syv undersøkte biomarkørene ACVR2A, BTDB7, DIDO1, MRE11, RYR3, SEC31A og SULF2. Hvilke av biomarkører som det er påvist endringer i, blir angitt i svarrapporten.

MSI (Mikrosatelitt instabilitet) NEGATIV. Mikrosatelitt stabil fenotype (MSS).

• En MSS-status for en prøve blir angitt når det er IKKE PÅVIST endringer i seks eller flere av biomarkørene. Se Feilkilder/ Metodens begrensninger for ytterligere vurderinger.

MSI (Mikrosatelitt instabilitet) INKONKLUSIV.

• En INKONKLUSIV status for en prøve blir angitt når den interne prosesskontrollen i analysen for 5 eller flere av de syv biomarkørene ikke er godkjent. Se Feilkilder/Metodens begrensninger for mulige årsaker.

5-7 virkedager fra prøven mottas ved Seksjon for Molekylær genetisk diagnostikk.

For å påvise endringer i biomarkørene må det være tilstrekkelig andel av neoplastiske celler med endring i biomarkørene, for å kunne påvises. En NEGATIV/IKKE PÅVIST status for en biomarkør utelukker ikke tilstedeværelsen av en endring, siden resultatet er avhengig av prosentandel neoplastiske celler i det undersøkte FFPE-vevssnitte(ne). Det anbefales å bruke prøver med minst 20 % neoplastiske celler.

Årsaker til et INKONKLUSIV resultat for en biomarkør kan være forekomst av hemmere i prøven, DNA-fragmentering, for mye/lite vevsmengde inn i analysekassetten. Ved INKONKLUSIVT resultat må det vurderes om prøvemateriale fra annen blokk/sn