FHI bidrar til nasjonal epidemiologisk overvåking, utbruddsetterforskning, forebygging og bekjempelse av Yersinia-infeksjoner.

FHI har referansefunksjon for Yersinia. Yersiniose er meldingspliktig til MSIS etter gitte kriterier.

• PASIENTRETTET: Species og serotype for korrekt diagnose (ICD-10 kode A04.6 Enteritt som skyldes Y. enterocolitica) og evt. smitteverntiltak for enkeltpasienter.
• FOLKEHELSERETTET: Utbruddsovervåkning, overvåkning av antibiotikaresistens.

Alle førstegangsisolater av humanpatogene Y. enterocolitica og Y. pseudotuberculosis sendes som renkultur til FHI. Isolater sendes inn for videre undersøkelse dersom det ikke med høy sannsynlighet kan utelukkes å være en av disse to species. Isolater som påvises ved eventuelt sykdomsresidiv mindre enn 3 måneder etter siste positive prøve skal ikke sendes inn med mindre det foreligger grunn til å mistenke reinfeksjon. Dersom Yersinia isoleres fra ulike prøvematerialer (for eksempel feces, blod eller spinalvæske), bør førstegangsisolatet fra «det klinisk mest alvorlige» materialet sendes inn.

• Innsending av prøver til mikrobiologiske undersøkelser
• Praktisk veiledning: prøvemengde, medium, kjøling og pakking
• Renkultur av bakterieprøver
• FHI: Skjemaer - samleside

Alle prøver skal sendes inn sammen med utfylt rekvisisjonsskjema.

• Innsending av prøver til mikrobiologiske undersøkelser
• Praktisk veiledning: prøvemengde, medium, kjøling og pakking

Alle innsendte Yersinia-isolater verifiseres spektrofotometrisk (MALDI-TOF MS) og humanpatogene Y. enterocolitica bekreftes ved hjelp av salicin.

Humanpatogene Y. enterocolitica isolater ogYersinia isolater fra invasive infeksjoner blir helgenomsekvensert.

Helgenomsekvensering benyttes til serotyping og molekylærepidemiologisk typing.

Antibiotikaresistens bestemmes i overvåkningsøyemed (publiseres i NORM-rapporten).

Helgenomsekvensering påviser serotype [1], sekvenstype (ST) ved multilokus sekvenstyping (MLST) [2] og clustertype (CT) ved kjernegenom MLST [3].

Resistenstesting av Yersinia gjøres primært for rapportering til NORM:

1. fenotypisk AMR-testing med lappediffusjon i henhold til EUCAST protokoll.

2. Genotypiske resultater basert på bioinformatisk analyse med NCBI AMRFinderPlus kjørt i Ridom SeqSphere.

Endlige svar for isolater som blir helgenosekvensert sendes når helgenomresultat foreligger. Prøven svares ut med species identifikasjon, serotype, sekvenstype (ST) og clustertype (CT).

Apatogene Yersinia isolater svares ut ved hjelp av salicin.

Apatogene Yersinia isolater svares ut innen 3-5 dager.

Isolater som blir helgenomsekvensert svares ut vanligvis ca 3 uker etter mottak.

Analyser av Yersinia er ikke akkreditert, men kvalitetssikret i henhold til ISO 17025.