Genpaneler som begynner på
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
Æ
Ø
Å

Migrasjonsforstyrrelser og pontocerebellær hypoplasi

Sist oppdatert: 25.09.2024
Utgiver: Oslo universitetssykehus
Versjon: 0.11
Kopier lenke til dette emnet
Foreslå endringer/gi kommentarer

Panelbeskrivelse 

Genpanel for migrasjonsforstyrrelser kan rekvireres som ledd i diagnostisk utredning av barn og voksne med migrasjonsforstyrrelser/ medfødte cortikale malformasjoner.

 

Genpanelet omfatter tilstander forbundet med:

  • primær microcephali

  • primær macro-/ megalencephali

  • lissencephali

  • pachygyri

  • heterotopi

  • polymicrogyri

  • porencephali

  • schizencephali.

  • Panelet inkluderer også gener forbundet med pontocerebellær hypoplasi og holoprosencephali.

 

 

For tilstander hvor det er mistanke om somatisk mosaisisme må vi undersøke DNA fra affisert vev. Prøvemateriale kan være en biopsi fra affisert hud, eller kirurgisk preparat fjernet i forbindelse med operasjon. OBS! Formalinfikserte preparater er ikke egnet for dypsekvensering, prøvematerialet bør fryses eller oppbevares kortvarig i saltvann. Hudbiopsi bør ikke dyrkes forut for eksomanalyse.

 

Lavgradig mosaikk-varianter < 10% er vanskelig å detektere i bioinformatisk pipeline, og manuell inspeksjon av rådatata er nødvendig. Dette er tidkrevende og bør begrenses til et lite antall gen. Alle varianter < 10% verifiseres med ddCPR

 

For informasjon om hvilke gener som inngår i tidligere, utgåtte versjoner av panelet, vises det til genliste på Genetikkportalen (www.genetikkportalen.no).

Genliste 

Migrasjonsforstyrrelser versjon 04

 

ACTB
ACTG1
ADGRG1
AHI1
AKT1
AKT3
AMPD2
AP1S2
APC2
ARF1
ARFGEF2
ARHGAP31
ARX
ASNS
ASPM
ASXL1
ATP1A2
ATP1A3
ATP6V0A2
ATR
B3GALNT2
B4GAT1
BICD2
BRAF
CASK
CCDC22
CCND2
CDK5
CDK5RAP2
CDON
CENPJ
CEP152
CEP85L
CHMP1A
CIT
CLP1
CNTNAP2
COL18A1
COL3A1
COL4A1
COL4A2
CRADD
CRB2
CRPPA
CSNK2A1
CTNNA2
CUL4B
DAG1
DCHS1
DCX
DDX3X
DEPDC5
DHCR7
DISP1
DKC1
DLL1
DLL4
DNMT3A
DOCK6
DYNC1H1
EMG1
EML1
EMX2
EOGT
EOMES
EPG5
ERCC1
ERCC5
ERCC6
ERMARD
EXOSC3
EXOSC8
EZH2
FAT4
FGF8
FGFR1
FH
FIG4
FKRP
FKTN
FLNA
FLVCR2
GAS1
GFAP
GLI2
GMPPB
GPSM2
GRIN1
GRIN2B
HEPACAM
HNRNPK
HSD17B4
IER3IP1
JAM3
KATNB1
KIDINS220
KIF11
KIF14
KIF2A
KIF5C
KIFBP
KNL1
KPTN
L1CAM
LAMA2
LAMB1
LAMC3
LARGE1
MACF1
MAN2C1
MAP1B
MAPK8IP3
MAST1
MCPH1
MED12
MED25
MLC1
MTOR
MYCN
NBN
NDE1
NEDD4L
NFIX
NOTCH1
NPRL2
NPRL3
NSD1
NSDHL
OCLN
OFD1
OPHN1
OSGEP
PAFAH1B1
PCNT
PEX1
PEX10
PEX12
PEX13
PEX14
PEX16
PEX19
PEX2
PEX26
PEX3
PEX5
PEX6
PI4KA
PIDD1
PIK3CA
PIK3R2
PLK4
PNKP
POMGNT1
POMGNT2
POMK
POMT1
POMT2
PTCH1
PTEN
PTF1A
QARS1
RAB18
RAB3GAP1
RAB3GAP2
RARS2
RBBP8
RBM10
RBPJ
RELN
RHEB
RTEL1
RTTN
RXYLT1
SCN3A
SEPSECS
SHH
SHMT2
SIX3
SLC25A19
SLC35A2
SMO
SNAP29
SRD5A3
STAMBP
STIL
STRADA
SUFU
TBC1D20
TBC1D7
TCTN1
TGIF1
TMEM216
TMTC3
TMX2
TOE1
TP73
TRAIP
TSC1
TSC2
TSEN2
TSEN54
TUBA1A
TUBA8
TUBB
TUBB2A
TUBB2B
TUBB3
TUBB4A
TUBG1
TUBGCP2
TUBGCP4
TUBGCP6
USP18
VLDLR
VPS13B
VPS53
VRK1
WASHC5
WDR62
ZIC2

Metodebeskrivelse og -begrensninger 

Det utføres genomsekvensering med kopitallsanalyse ved analyse av DNA fra blod.

DNA fra affisert biopsi/vev eksomsekvenseres (WES) for å få mer dybde og lettere oppdage mosaikker.

 

Se Metodebeskrivelse og -begrensninger