For tilstander hvor det er mistanke om somatisk mosaisisme må vi undersøke DNA fra affisert vev. Prøvemateriale kan være en biopsi fra affisert hud, eller kirurgisk preparat fjernet i forbindelse med operasjon. OBS! Formalinfikserte preparater er ikke egnet for dypsekvensering, prøvematerialet bør fryses eller oppbevares kortvarig i saltvann. Hudbiopsi bør ikke dyrkes forut for eksomanalyse.
Lavgradig mosaikk-varianter < 10% er vanskelig å detektere i bioinformatisk pipeline, og manuell inspeksjon av rådatata er nødvendig. Dette er tidkrevende og bør begrenses til et lite antall gen. Alle varianter < 10% verifiseres med ddCPR
For informasjon om hvilke gener som inngår i tidligere, utgåtte versjoner av panelet, vises det til genliste på Genetikkportalen (www.genetikkportalen.no).
RASopatier versjon 02
BRAF |
CBL |
HRAS |
KRAS |
LZTR1 |
MAP2K1 |
MAP2K2 |
MRAS |
NF1 |
NRAS |
PPP1CB |
PTPN11 |
RAF1 |
RASA2 |
RIT1 |
RRAS |
RRAS2 |
SHOC2 |
SOS1 |
SOS2 |
SPRED1 |
Det utføres genomsekvensering med kopitallsanalyse ved analyse av DNA fra blod.
DNA fra affisert biopsi/vev eksomsekvenseres (WES) for å få mer dybde og lettere oppdage mosaikker.