Genpaneler som begynner på
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
Æ
Ø
Å

RASopatier

Sist oppdatert: 26.09.2024
Utgiver: Oslo universitetssykehus
Versjon: 0.11
Kopier lenke til dette emnet
Foreslå endringer/gi kommentarer

Panelbeskrivelse 

  • RASopatier er en gruppe syndromer med genfeil i samme reaksjonsvei, og klinikk med vekstavvik, misdannelser og utviklingshemming (omfatter Noonan, CFC, LEOPARD, Costello, Legius syndrom m.fl.).
  • Mange pasienter har en de novo variant som årsak, men ved f. eks. Noonan syndrom anslås det at 30-75% av pasientene har dominant nedarvet sykdom (en affisert forelder). Genpanelet analyseres derfor uten foreldreprøver (ikke trioanalyse).
  • Analysen kan rekvireres som ledd i utredning av pasienter med forsinket utvikling eller misdannelser som gir mistanke om RASopati, som f. eks. Noonan syndrom. Flere av følgende bør være til stede: Ernærningsvansker, relativ makrokefali, kortvoksthet, psykisk utviklingshemming, pulmonal stenose, kardiomyopati, annen medfødt hjertefeil, arytmi, hudforandringer eller malignitet.
  • Genpanelet inkluderer gener som har dokumentert årsakssammenheng med RASopatier inkludert NF1 (Neurofibromatosis-Noonan syndrom). Prøven analyseres som singleprøve (UNO), men foreldreprøver kan bli etterspurt ved behov for å avklare varianter hos pasienten.

 

 

For tilstander hvor det er mistanke om somatisk mosaisisme må vi undersøke DNA fra affisert vev. Prøvemateriale kan være en biopsi fra affisert hud, eller kirurgisk preparat fjernet i forbindelse med operasjon. OBS! Formalinfikserte preparater er ikke egnet for dypsekvensering, prøvematerialet bør fryses eller oppbevares kortvarig i saltvann. Hudbiopsi bør ikke dyrkes forut for eksomanalyse.

 

Lavgradig mosaikk-varianter < 10% er vanskelig å detektere i bioinformatisk pipeline, og manuell inspeksjon av rådatata er nødvendig. Dette er tidkrevende og bør begrenses til et lite antall gen. Alle varianter < 10% verifiseres med ddCPR

 

For informasjon om hvilke gener som inngår i tidligere, utgåtte versjoner av panelet, vises det til genliste på Genetikkportalen (www.genetikkportalen.no).

Genliste 

RASopatier versjon 02

 

BRAF
CBL
HRAS
KRAS
LZTR1
MAP2K1
MAP2K2
MRAS
NF1
NRAS
PPP1CB
PTPN11
RAF1
RASA2
RIT1
RRAS
RRAS2
SHOC2
SOS1
SOS2
SPRED1

Metodebeskrivelse og -begrensninger 

Det utføres genomsekvensering med kopitallsanalyse ved analyse av DNA fra blod.

DNA fra affisert biopsi/vev eksomsekvenseres (WES) for å få mer dybde og lettere oppdage mosaikker.

 

Se Metodebeskrivelse og -begrensninger