For tilstander hvor det er mistanke om somatisk mosaisisme må vi undersøke DNA fra affisert vev. Prøvemateriale kan være en biopsi fra affisert hud, eller kirurgisk preparat fjernet i forbindelse med operasjon. OBS! Formalinfikserte preparater er ikke egnet for dypsekvensering, prøvematerialet bør fryses eller oppbevares kortvarig i saltvann. Hudbiopsi bør ikke dyrkes forut for eksomanalyse.
Lavgradig mosaikk-varianter < 10% er vanskelig å detektere i bioinformatisk pipeline, og manuell inspeksjon av rådatata er nødvendig. Dette er tidkrevende og bør begrenses til et lite antall gen. Alle varianter < 10% verifiseres med ddCPR
RASopatier versjon 2.0.0
BRAF |
CBL |
HRAS |
KRAS |
LZTR1 |
MAP2K1 |
MAP2K2 |
MRAS |
NF1 |
NRAS |
PPP1CB |
PTPN11 |
RAF1 |
RASA2 |
RIT1 |
RRAS |
RRAS2 |
SHOC2 |
SOS1 |
SOS2 |
SPRED1 |
Det utføres genomsekvensering med kopitallsanalyse ved analyse av DNA fra blod.
DNA fra affisert biopsi/vev eksomsekvenseres (WES) for å få mer dybde og lettere oppdage mosaikker.
Svartid regnes fra prøven er mottatt i vårt laboratorium til svarrapport er sendt ut fra vårt laboratorium. Ta kontakt med laboratorielege ved ønsker om prioritering av enkelte analyser (tlf. 23016636).
For detaljert oversikt over våre svartider se Serviceerklæringen.