M-kopper (også kalt mpox) er en zoonose forårsaket av apekoppevirus (MPXV). Pasientdiagnostikk utføres med PCR regionalt. Avdeling for virologi ved Folkehelseinstuttet utfører helgenomsekvensering på innsendte eluater fra PCR-positive tilfeller som ledd i nasjonal overvåking av M-kopper.
Informasjon om sykdommen og diagnostikk finnes i Smittevernhåndboka - M-kopper.
PCR-positiv prøve for MPXV.
Siden det ikke er opprettet noen referansefunksjon for MPXV er det ingen innsendingsplikt. Imidlertid anbefaler WHO sekvensering av alle tilfeller av M-kopper i land med lav/sporadisk forekomst, slik som Norge.
Det er derfor ønskelig at primærlaboratorier sender eluater fra alle positive prøver inn til Avdeling for virologi ved Folkehelseinstituttet, hvor det er etablert helgenomsekvensering av MPXV for å kunne utføre nasjonal overvåking.
Eluat. Hvis flere eluater fra samme pasient foreligger, ønskes eluatet med lavest CT-verdi, da dette er best egnet for sekvensering.
Prøvene sendes på kjøl. Dersom de allerede er frosset sendes de frossent til FHI.
For innsending benyttes Rekvisisjon for mikrobiologiske undersøkelser.
Følgende opplysninger må minimum fylles ut:
Viser til Innsending av prøver til mikrobiologiske undersøkelser for postadresse.
Amplikonbasert NGS. Analyseres med Nanopore teknologi.
Innsendte prøver med tilstrekkelig god kvalitet vil helgenomsekvenseres med NanoPore-teknologi etablert og verifisert for MPXV.
Klade og lineage.
I tillegg oppgis stammenavn på svarbrevet. Stammenavnet genereres ved FHI og er unikt for hvert innsendte isolat. Stammenavn kan brukes av rekvirenten til å finne mer informasjon, dersom gensekvensen deles med internasjonale databaser av FHI.
Aina Elisabeth Fossum Moen (Fagansvarlig)