Rotavirus

Sist oppdatert: 27.09.2023
Utgiver: Folkehelseinstituttet
Versjon: 0.2
Kopier lenke til dette emnet
Foreslå endringer/gi kommentarer

Innledning 

Folkehelseinstituttet (FHI) har referansefunksjon for rotavirus for å bidra til nasjonal overvåking av barnevaksinasjonsprogrammet. Rotavirussykdom er meldepliktig til MSIS.For informasjon om rotavirus vises det til smittevernveilederen.

 

Primærdiagnostikk utføres med PCR ved mange av landets laboratorier, og er ofte en del av et panel for flere tarmpatogene agens ved utredning av gastroenteritt. Vaksinestamme-PCR utføres ved St.Olavs og ved FHI. FHI gjør ikke primærdiagnostikk.

Indikasjon  

  • Vaksinestamme-PCR ved spørsmål om påvist rotavirus er vaksinestamme. Noen barn skiller ut vaksinevirus i avføringen en uke eller mer etter vaksinasjon, og det er vanligst etter første dose.
  • Bistår primærlaboratorier ved forespørsel/spesielle problemstillinger.
  • Overvåkning (se innsendingsplikt).

Innsendingsplikt 

Det er gjort avtale med 5 mikrobiologiske laboratorier for innsending av prøver til overvåkning.

Rekvisisjon og forsendelse 

For innsending benyttes Rekvisisjon for mikrobiologiske undersøkelser.

 

Følgende opplysninger fylles ut avhengig av indikasjon:

  • Klinikk, reiseanamnese, vaksinasjonsstatus, mistanke om utbrudd/nærkontakt til kjent tilfelle.
  • Det må merkes tydelig om prøven er sendt inn som ledd i overvåkning, eller av andre grunner.
  • Primærlaboratoriets resultater: Ct-verdi.

 

Viser til Innsending av prøver til mikrobiologiske undersøkelser for postadresse.

Prøvemateriale 

Rotavirus-positive avføringsprøver, rektalpensel eller sterilt glass, fortrinnsvis 1 ml, minst 200µl (evt. nukleinsyrepreparat i spesielle tilfeller, minst 50 µl ). Avføringsprøver bør oppbevares kjølig, og ideelt sett transporteres kjølig, men transport i romtemperatur er greit ved kort transporttid (over natt).

Analyser  

Analyse
Rotavirus-PCR kvalitativ RT-PCR (Ridagene Rotavirus real-time RT-PCR)
Rotavirus vaksinestamme kvalitativ RT-PCR (Rotarix NSP2 in-house real time RT-PCR)
Helgenomsekvensering er under etablering

Oppbevaring av prøvemateriale 

Prøven fryses ned etter analysering og oppbevares i vårt frysearkiv i minst 10 år.

Svar  

PCR: Påvist/Ikke påvist

Genotyping: Genotype-resultater svares ikke ut til rekvirent, men vil rapporteres i årsrapporten til Hdir og i barnevaksinasjonsrapporten.

Svartid 

  • Spørsmål om vaksinestamme: PCR-analysene gjøres rutinemessig hver 3-4 uke. Ved ønske om raskere svar må dette beskrives tydelig på rekvisisjonen og begrunnes.
  • Overvåkningsprøver: Overvåkningsprøver analyseres ikke regelmessig, og ved store prøvevolum vil det gjøres et utvalg til genotyping.

Merknader 

Følgende analyser utføres ikke lenger:

  • Påvisning av rotavirus antigen i fæces eller rektalpensel (RIDASCREEN Rotavirus Antigen EIA, R-Biopharm)
  • Genotyping av rotavirus VP4 og VP7 i fæces og rektalpensler ved multiplex semi-nested RT-PCR.
  • VP6 gen ved spesifikk qRT-PCR (in-house).

Fagansvarlige  

 

Laboratoriet har ikke mulighet til å svare på henvendelser fra privatpersoner.