AGENS a-å
- Bacillus anthracis
- Bordetella pertussis (kikhoste)
- Brucella
- Burkholderia
- Campylobacter
- Tetanus (Clostridium tetani)
- Clostridium botulinum
- Corynebacterium diphtheriae (difteri)
- Coxiella burnetii (Q-feber)
- Krim-Kongo hemoragisk feber virus (CCHFV)
- Ebolavirus og Marburgvirus (filovirus)
- Enteroaggregativ E. coli (EAEC)
- Enterohemoragisk E. coli (EHEC)
- Enteroinvasive E. coli (EIEC)
- Enteropatogene E. coli (EPEC)
- Enterotoksigen E. coli (ETEC)
- Francisella tularensis
- Haemophilus influenzae
- Hepatitt E virus
- Influensavirus
- Lassavirus
- Leptospira
- Listeria monocytogenes
- Meslinger (MeV)
- (kapittel) Mykobakterier/Tuberkulosebakterier
- Neisseria gonorrhoeae (gonokokker)
- Neisseria meningitidis (meningokokker)
- Parotitt-virus (kusma)
- Rotavirus
- Polio (enterovirus)
- RS-virus (respiratorisk syncytialt virus / humant orthopneumovirus)
- Rubellavirus (røde hunder)
- Salmonella
- SARS-coronavirus 2 (SARS-CoV-2)
- Shigella
- Streptococcus pneumoniae (pneumokokker)
- Streptococcus pyogenes (GAS)
- Vibrio (kolera, vibriose)
- Yersinia enterocolitica
- Yersinia pestis
- Zoonotisk influensavirus
- Flere agens vil komme....
Yersinia pestis
Innledning
Pest er en bakteriell zoonose forårsaket av bakterien Yersinia pestis.
Y. pestis er klassifisert i smitterisikogruppe 3, og diagnostikk bør derfor utføres på BSL3-laboratorium. Bakterien regnes som et mulig biologisk stridsmiddel.
For utbredelse, smittemåte og klinikk etc., se smittevernveilederens kapittel om pest.
Pest (klinisk) eller påvisning av bakterien er meldingspliktig til MSIS etter gitte kriterier.
Indikasjon
Ved mistanke om Y. pestis i kliniske prøver sendes prøvemateriale eller kultur inn til Beredskapslaboratoriet for videre undersøkelse.
PASIENTRETTET
- Diagnose, behandling og smittevern rundt enkeltpasienter.
FOLKEHELSERETTET
- Mikrobiologisk beredskap og samarbeid nasjonalt og internasjonalt for et agens som kan benyttes som bioterror.
Innsendingsplikt
Alle mistenkte prøver sendes til Beredskapslaboratoriet for påvisning og identifikasjon.
Prøvemateriale
Aktuelt klinisk prøvemateriale er f.eks. sårsekret, luftveissekret eller blodkultur. Annet prøvemateriale kan analyseres etter avtale. Laboratoriet tar også imot kulturer.
Rekvisisjon, pakking og forsendelse
- Innsending av prøver avtales med Mikrobiologisk beredskapsvakt forut for forsendelse.
- FHI rekvisisjon for mikrobiologiske analyser
- Kulturer av Y. pestis sendes som biologisk materiale i kategori A.
Analyser
- Molekylær påvisning direkte på mottatt prøvemateriale ved Filmarray og bekreftende molekylær påvisning ved real time-PCR på oppdyrket materiale.
- Dyrkning og fenotypisk/biokjemisk identifikasjon.
- Resistensbestemmelse ved mikrobuljongfortynningsmetode.
Svar
Påvist/ikke påvist.
Foreløpig svar basert på molekylære analyser direkte på klinisk prøvmateriale ringes ut. Det samme gjelder resistenssvar når dette foreligger.
Endelig svar basert på bekreftende analyser svares ut skriftlig.
Svartid
Hasteprøver svares som regel ut foreløpig pr. telefon i løpet av 2-3t.
Dyrkningssvar foreligger etter 24-48t.
Resistensbestemmelse utføres ikke på helg, og svar foreligger etter 1-2 uker.
Akkreditert
Analyser for Y. pestis er ikke akkreditert, men kvalitetskontrollert i henhold til ISO 17025 (Prøvings- og kalibreringslaboratorier).
Fagansvarlige
Faglig ansvarlig (overordnet metodeansvar)
Medisinsk-faglig ansvarlig (kliniske vurderinger, forsvarlighet iht helselovgivningen)
Referanser
- Janse, I., Hamidjaja, R.A., Bok, J.M. et al. Reliable detection of Bacillus
anthracis, Francisella tularensis and Yersinia pestis by using multiplex qPCR including
internal controls for nucleic acid extraction and amplification. BMC Microbiol 10, 314 (2010). - Tomaso, H., Reisinger, E.C., Al Dahouk, S., Frangoulidis, D., Rakin, A., Landt, O. and
Neubauer, H. (2003), Rapid detection of Yersinia pestis with multiplex real-time PCR assays
using fluorescent hybridisation probes. FEMS Immunology & Medical Microbiology, 38:
117-126. - Riehm JM, Rahalison L, Scholz HC, Thoma B, Pfeffer M, Razanakoto LM, Al Dahouk S, Neubauer H, Tomaso H. Detection of Yersinia pestis using real-time PCR in patients with suspected bubonic plague. Mol Cell Probes. 2011 Feb;25(1):8-12. doi: 10.1016/j.mcp.2010.09.002. Epub 2010 Oct 8. PMID: 20933595.
