Genpaneler som begynner på
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
Æ
Ø
Å

Glykosyleringsdefekter (CDG)

Sist oppdatert: 23.09.2024
Utgiver: Oslo universitetssykehus
Versjon: 0.12
Kopier lenke til dette emnet
Foreslå endringer/gi kommentarer

Panelbeskrivelse 

  • Medfødte glykosyleringsdefekter (Congenital Disorders of Glycosylation) er en gruppe hovedsakelig autosomalt recessivt arvelige sykdommer som affiserer syntesen av sukkerkjeden som inngår i glykoproteiner. Sukkerkjedene (glykanene) er definert etter tilkoblingen til proteinet.
  • Det er flere hovedformer for proteinglykosylering, N-glykosylering der glykanet festes på aminosyren asparagin og O-glykosylering der glykanet festes på aminosyrene treonin eller serin. Pasientene får som regel symptomer fra flere organsystemer, nervesystemet er nesten alltid påvirket (det finnes unntak). Alle andre organsystemer kan i prinsippet være affisert, blant annet hjerte, lever, tarm, øye og skjelett. Det er svært stor variasjon i alvorlighetsgrad og symptombilde.
  • Medfødte glykosyleringsdefekter manifesterer seg oftest i barndommen, men kan debutere i alle aldre. Ved medfødte, komplekse utviklingsavvik bør det fortrinnsvis rekvireres genpanel for utviklingsavvik med mindre det foreligger særskilt mistanke om glykosyleringsdefekt.

  • Før genpanelet rekvireres må biokjemisk screening for medfødt metabolsk sykdom være utført, inkludert kapillærelektroforese av serum transferrin (CDT) som er en screening for N-glykosyleringsdefekter. Slik analyse utføres ved OUS-RH-MBK.
  • Ved avvikende transferrinmønster kan genpanelet rekvireres. Hos etnisk norske pasienter med type 1 transferrinmønster bør det først rekvireres analyse av PMM2. Ved negativ biokjemisk screening kan sterk klinisk mistanke rettferdiggjøre rekvirering av genpanelet, og da spesielt siden O-glykosyleringsdefektene ikke vil oppdages ved kapillærelektroforese av serum transferrin.

 

Genpanelet er basert på

  • Jaeken J, Péanne R 2017 J Inherit Metab Dis 40:569

  • Sparks SE et al; Congenital Disorders of N-Linked Glycosylation and Multiple Pathway Overview, sist oppdatert 12.01.17 og fritt tilgjengelig på www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1332/

  • IEMbase (www.iembase.org)

Genliste 

Glykolyseringsdefekter (CDG) versjon 01

 

A4GALT
ALG1
ALG11
ALG12
ALG13
ALG14
ALG2
ALG3
ALG6
ALG8
ALG9
ATP6AP1
ATP6AP2
ATP6V0A2
ATP6V1A
ATP6V1E1
B3GALNT2
B3GALT6
B3GAT3
B3GLCT
B4GALNT1
B4GALT1
B4GALT7
B4GAT1
BPNT2
C1GALT1C1
CAD
CANT1
CCDC115
CHST11
CHST14
CHST3
CHST6
CHSY1
COG1
COG2
COG4
COG5
COG6
COG7
COG8
CRPPA
CSGALNACT1
DDOST
DHDDS
DOLK
DPAGT1
DPM1
DPM2
DPM3
DSE
EOGT
EXT1
EXT2
EXTL3
FKRP
FKTN
FUT8
G6PC3
GALNT3
GANAB
GFPT1
GMPPA
GMPPB
GNE
GPAA1
JAGN1
LARGE1
LFNG
MAGT1
MAN1B1
MGAT2
MOGS
MPDU1
MPI
NANS
NUS1
OGT
PAPSS2
PGAP1
PGAP2
PGAP3
PGM1
PGM3
PIGA
PIGC
PIGG
PIGH
PIGL
PIGM
PIGN
PIGO
PIGP
PIGQ
PIGT
PIGV
PIGW
PMM2
POFUT1
POGLUT1
POMGNT1
POMGNT2
POMK
POMT1
POMT2
PRKCSH
RFT1
RXYLT1
SEC23B
SLC26A2
SLC35A1
SLC35A2
SLC35A3
SLC35C1
SLC35D1
SLC39A8
SRD5A3
SSR3
SSR4
ST3GAL3
ST3GAL5
STT3A
STT3B
TMEM165
TMEM199
TRAPPC11
TRIP11
TUSC3
VPS13B
XYLT1
XYLT2

METODEBESKRIVELSE OG -BEGRENSNINGER 

Det utføres genomsekvensering med kopitallsanalyse.

Se Metodebeskrivelse og -begrensninger