Molekylære analyser, solide svulster
Mikrosatellitt instabilitet (MSI)
Prøvemateriale
Formalinfiksert, parafininnstøpt (FFPE) vev.
Patologilaboratoriene behøver ikke å sende fra seg parafinblokker. DNA isoleres fra snitt montert på objektglass. Innsendt snitt vil ikke bli returnert.
HE-farget snitt + 4 stk. 10μm ufargede snitt montert på objektglass (evt. blokk, dersom det ikke er mulighet for å lage snitt).
Minimum 20% neoplastiske celler.
Utførende laboratorium
Forventet svartid
Forventet svartid er innen 7 virkedager.
Undersøkelsesprinsipp
dylla™ MSI Test er en fullautomatisert test som utføres på Biocartis Idylla™-systemet. Analysen består av rensing av nukleinsyrer fra FFPE og PCR på syv monomorfe biomarkører. En høyoppløselig smeltekurveanalyse utføres på PCR-produktene.
Svar
Resultatet rapporteres som:
- Negativ. Tumor med mikrosatellitt stabil (MSS) fenotype
- Positiv. Tumor med mikrosatellitt instabil (MSI) fenotype
- Inkonklusiv
Tolkning
Idylla software tolker og rapporterer MSI status dersom de interne prosesskontrollene godkjennes.
- Dersom minst to av biomarkørene tolkes som mutert vil prøven rapporteres som mikrosatellitt instabil fenotype (MSI-High).
- Dersom én eller ingen av biomarkørene tolkes som mutert vil prøven rapporteres som mikrosatellitt stabil (MSS).
- Dersom tre eller flere av biomarkørene feiler på de interne prosesskontrollene vil prøven rapporteres som inkonklusiv.
Måleusikkerhet
- Metoden er validert med FFPE fra vev med opphav fra kolorektal tumor. Vev med annet opphav kan ha annen mutasjonsprofil med varianter i andre biomarkører enn disse syv, og dermed feiltolkes som mikrosatellitt stabil fenotype (MSS). Annet vev er ikke validert.
- Tilstedeværelse av mutasjon i de syv biomarkørene kan ikke utelukkes selv om den tolkes som ikke mutert, siden resultater er avhengig av tilstrekkelig prosentandel av muterte alleler i prøven.
- DNA-fragmentering/lav forekomst av amplifiserbart DNA kan resultere i inkonklusivt resultat.
Annet
De syv monomorfe bioarkørene:
En total vurdering av resultatet på de syv biomarkørene og prøvens integritet avgjør prøvens MSI-status.
Nyttige lenker
Vi kan ikke love deg svar på tilbakemeldingen din, men bruker den til å forbedre innholdet. Vi ber om at du ikke deler person- eller helseopplysninger.
Vi kan ikke love deg svar deg på tilbakemeldingen din, men bruker den til å forbedre innholdet. Vi ber om at du ikke deler person- eller helseopplysninger.
