DPYD

DPYD er genet som koder for enzymet dihydropyrimidin dehydrogenase (DPD). Dette enzymet er det viktigste enzymet i nedbrytningen av fluoropyrimidiner (5-fluorouracil, kapecitabin og tegafur). Det er store individuelle forskjeller i aktiviteten til DPD. Redusert eller manglende aktivitet er assosiert med økt risiko for toksisitet og alvorlige og dødelige bivirkninger ved behandling med flouropyrimidiner. En rekke varianter av DPYD-genet er kjent. For fire varianter (c.1905+1G >A (*2A), c.1679T >G (*13), c.1236G >A (del av HapB3) og c.2846A >T) foreligger det evidens for at den reduserte enzymaktiviteten de medfører gir økt risiko for alvorlig toksisitet. Våren 2020 kom EMA (European Medicines Agency) med anbefalinger om genotyping av DPYD i forkant av behandling med fluoropyrimidiner (1,2).

Planlagt behandling med fluoropyrimidiner.

Pasientforberedelse

Ingen.

Prøvetaking

4 mL EDTA-blod. Glasset skal ikke åpnes før det sendes til laboratoriet. Ved svært vanskelig prøvetaking kan det være tilstrekkelig med 0,5 mL EDTA-blod. EDTA-blod er holdbart 5 døgn i romtemperatur, 4 uker i kjøleskapstemperatur og 3 måneder i -20 °C.

Forekomsten av DPYD-genvarianter varierer mellom folkegrupper. De fire genvariantene (c.1905+1G >A (*2A), c.1679T >G (*13), c.1236G >A og c.2846A >T) det testes for er de som hyppigst er kjent å kunne gi manglende/redusert mengde DPD hos kaukasiere.

Dersom analysen ikke påviser noen av de fire variantene det analyseres for, rapporteres resultatet som * 1 (villtype, antatt normal enzymaktivitet).

Selv om ingen av de fire sekvensvariantene det undersøkes for påvises, kan det ikke utelukkes at pasienten har andre årsaker til redusert enzymaktivitet.

Analyseresultatet gis ut som allelkombinasjon av henholdsvis de fire genvariantene det testes for og villtype (*1).

Samlet aktivitet av DPD avhenger av hvilke varianter pasienten har i begge sine alleler. * 2A og *13 gir manglende enzymaktivitet, mens c.1236G >A og c.2846A >T gir redusert aktivitet. For å predikere samlet enzymaktivitet benyttes en aktivitetsscore for hvert allel. Varianter som gir redusert funksjon gis en score på 0,5. Varianter som gir manglende funksjon gis en score på 0. Varianter som gir normal funksjon (villtype/*1) gis en score på 1.

Resultatet av analysen vil følges av en kommentar med anbefalinger om dose.

Enzymaktiviteten hos heterozygote pasienter med samme genotype kan variere betydelig. Dette gjelder spesielt pasienter hvor det er påvist c. 2846A >T eller c.1236G >A. Individuell justering av dose hos disse pasientene er viktig.

Metode:

LAMP smeltekurveanalyse

Instrument: LightCycler

Svartid: Analyseres ukentlig. Lengre svartid må påberegnes i ferier/høytid.

Feilkilder: Ved blodtransfusjon kan man få blodtilbanding av givers leukocytter. Dette kan gi endret genotyperesultat. Det samme gjelder ved stamcelletransplantasjon hvor leukocytter er tilført.