Folkehelseinstituttet har medisinsk mikrobiologisk referansefunksjon for tarmpatogene E. coli, inklusive EAEC. Flere gener er markører for EAEC: aggR, aaiC og aatA.

For forekomst, inkubasjonstid, klinikk etc. se SMITTEVERNVEILEDERENs kapittel om E. coli enteritt. EIEC-infeksjon er meldepliktig til MSIS

• PASIENTRETTET: Patotype-bestemmelse for korrekt diagnose og evt. smitteverntiltak for enkeltpasienter
• FOLKEHELSERETTET: Nasjonal epidemiologisk overvåkning inklusive utbruddsdeteksjon- og etterforskning.

Ved funn av markør for EAEC og isolering av sannsynlig EAEC skal isolatet sendes til FHI for verdifsering og karakterisering.

Renkultur av sannsynlig EAEC.

• Mikrobiologiske rekvisisjoner FHI: Skjemaer samleside
• Innsending av prøver til mikrobiologiske undersøkelser
• Praktisk veiledning: prøvemengde, medium, kjøling og pakking

Helgenomsekvensering er hovedanalysen. Ved mistanke om utbrudd utføres evt. E. coli MLVA.

Helgenomsekvensering av EAEC utføres på samme måte som NGS for tarmpatogene E. coli

Ved mistanke om utbrudd utføres evt. E. coli MLVA.

Isolater fryses og oppbevares i minst 10 år.

Normalt ca. 3 uker fra mottat isolat. Ved utbrudd kan svartiden være kortere.

Analyser av tarmpatogene E. coli er ikke akkreditert, men kvalitetskontrollert i henhold til ISO 17025.

Faglig ansvarlig (overordnet metodeansvar)

• Lin C. T. Brandal (NGS, PCR)
• Mohammed Umaer Naseer (NGS, PCR)
• Polina Katsiouleri (fenotypi)

Medisinsk-faglig ansvarlig (kliniske vurderinger, forsvarlighet iht helselovgivningen)

• Polina Katsiouleri

SMITTEVERNVEILEDERENs kapittel om oppfølging ogs kontroll av personersom som håndterer næringsmidler.