Det best egnede prøvematerialet er bronkialskyllevæske. Alternativt kan indusert sputum undersøkes.
Det kan i enkelte tilfelle også være aktuelt å undersøke pleuravæske, lungebiopsi eller lungeautopsi.
P. jirovecii DNA kan også undersøkes i ekspektorat, eventuelt i munnskyllevann, men med betydelig lavere sensitivitet. Disse prøvematerialene kan ikke anvendes til P. jirovecii immunfluorescensundersøkelse.
Primært undersøkes prøvematerialet for tilstedeværelse av Pneumocystis jirovecii DNA. Dette er en meget sensitiv undersøkelse og svake positive funn kan representere kolonisering med P. jirovecii.
Prøveresultatene sammenholdes og kommenteres som angitt under "Tolkning". Som alltid er det viktig å sammenholde funnene med klinikk og andre undersøkelser.
P.jirovecii DNA sterk positiv (P. jiroveci immunfluorescens positiv eller negativ):
Pneumocystis pneumoni overveiende sannsynlig.
P.jirovecii DNA moderat positiv (og P. jirovecii immunfluorescens positiv): Pneumocystis pneumoni overveiende sannsynlig. Funn må sammenholdes med klinikk og radiologiske funn.
P.jirovecii DNA moderat positiv (og P. jiroveci immunfluorescens negativ): Pneumocystis pneumoni mulig. Funn må sammenholdes med klinikk og radiologiske funn. Behandling bør overveies hos immunsupprimert pasient.
P.jirovecii DNA svak positiv: Klinisk betydning usikker. Mulig kolonisering. Behandling kan overveies hos immunsupprimert pasient.