Biokjemiske analyser som begynner på ...
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
Æ
Ø
Å
1
2
5

APOE genotyping (Apolipoprotein E)

Sist oppdatert: 13.12.2023
  Sendeprøve: OUS, Rikshospitalet, Medisinsk Biokjemi
Utgiver: Vestre Viken HF
Versjon: 1.1
Kopier lenke til dette emnet
Foreslå endringer/gi kommentarer

Indikasjoner 

  • Mistanke om type III hyperlipoproteinemi.
    (Særlig typisk hvis total-kolesterol og triglyceridene i serum er økt til omtrent samme tallverdi i mmol/L.)
  • Videre utredning av allerede klinisk påvist demenssykdom

 

APOE-typing kan være ett av flere hjelpemidler til å skille ulike typer demens fra hverandre. Det er en forutsetning at demensdiagnosen allerede er stilt hos den enkelte pasient ved hjelp av klinisk og nevropsykologisk diagnostikk.


APOE-typing er ikke et egnet hjelpemiddel for å stille diagnosen demens og kan ikke og skal ikke benyttes til dette!


APOE-typing skal heller ikke benyttes prediktivt i den hensikt å prøve å anslå risiko for fremtidig utvikling av demens av Alzheimers type.

Prøvetakingsrutiner 

Pasientforberedelse

Ingen

 

Prøvetaking

  • Materiale: EDTA-fullblod.
  • Minste prøvevolum: 0,5 mL (helst 1 mL) fullblod.

 

Holdbarhet

  • Oppbevaring: Prøven er holdbar flere døgn i romtemperatur, men oppbevaring i kjøleskap anbefales. Ved lengre tids lagring ( >1 mnd) bør prøven fryses.
  • Forsendelse: Ordinær post, kan sendes ved romtemperatur.

 

Rekvisisjoner - Oslo universitetssykehus (oslo-universitetssykehus.no)

 

BS: APOE

Referanseområde 

Ikke relevant.

Utføres 

Avdeling for medisinsk biokjemi, Rikshospitalet.

Forventet svartid 

Vanligvis innen 2 uker, ta kontakt dersom det haster mer.

Analytisk og biologisk variasjon 

APOE2 (rs7412): Allelfrekvensen er 0,05-0,10 i kaukasiske befolkninger, og stort sett på samme i nivå også i andre befolkninger

 

APOE4 (rs429358): Allelfrekvensen er 0,10-0,15 i kaukasiske befolkninger, stort sett lavere i andre befolkningsgrupper)

Bakgrunn 

Apolipoprotein E (ApoE) er et glykoprotein som spiller en viktig rolle i lipidhomeostasen både i blodsirkulasjonen og i hjernen. I plasma er ApoE assosiert med kylomikronrester, VLDL og noen subpopulasjoner av HDL. Lipoprotein bundet til ApoE tjener som ligand for LDL-reseptoren og andre reseptorer.

 

ApoE forekommer i tre vanlige varianter: ApoE3 (Cys130; Arg176), ApoE2 (Arg176Cys) og ApoE4 (Cys130Arg). (Opprinnelig litteratur angav aminosyreposisjonene 112 og 158 i stedet for 130 og 176)

 

ApoE2 er assosiert med type III hyperlipoproteinemi. I sammenligning med de andre to isoformene har ApoE2 mindre enn 1% av bindingskapasiteten til den hepatiske LDL-reseptoren. Dette kan føre til høye nivåer av P-kolesterol og P-triglycerider og dermed tidlig arterosklerose. Homozygositet for ApoE2 forekommer hos ca. 1% av kaukasisk befolkning, mens frekvensen av type III hyperlipoproteinemi kun er 1-7 per 5000. Bare et fåtall av personer som er homozygote for ApoE2/E2 vil dermed utvikle type III hyperlipoproteinemi. Andre genetiske faktorer og miljøfaktorer er også avgjørende.

 

APOE4 er assosiert med demens av Alzheimers type. Mens omtrent 25% av kaukasiske befolkninger er bærere av APOE4, er forekomsten om lag 60-70 % hos Alzheimer-pasienter. Men det er viktig å være klar over at verken ett eller to APOE-alleler er tilstrekkelig eller nødvendig for å utvikle demens av Alzheimers type.

Tolkning 

Svarrapportering

  • APOE-genotype rapporteres enten kun basert på antallet APOE2-alleler som er til stede hvis indikasjonen er type III hyperlipoproteinemi
  • Dersom problemstilingen er videre utredning av allerede påvist klinisk demenssykdom, rapporteres svaret basert på resultatet av både APOE2- og APOE4-analysen.

 

Svartolkning

Homozygositet for genotype ApoE2 bekrefter diagnosen type III hyperlipoproteinemi i tilfeller der mistanken er sterk basert på verdiene av blodlipider. Fravær av homozygositet for APOE2 svekker diagnosen type III hyperlipoproteinemi i betydelig grad.

 

Homozygositet og i mindre grad heterozygositet for APOE4 styrker i noen grad mistanken om at klinisk påvist, sent debuterende demens kan være av Alzheimers type, men er på ingen måte diagnostisk for dette.

 

Usikkerhet

Hvis pasienten er stamcelletransplantert

  • Genotype i fullblod kan være forskjellig fra genotypen i kroppen for øvrig.

 

Hvis pasienten er organtransplantert

  • Genotype i fullblod kan være forskjellig fra genotypen til de(t) transplanterte organet/ene (f. eks. lever).

 

Blodtransfusjon

  • Kan i sjeldne tilfeller påvirke genanalyseresultatet dersom antall leukocytter som overføres under transfusjonen er betydelig i forhold til pasientens leukocyttantall. Kan evt. sjekke dette ved å analysere blodprøve tatt ved et annet tidspunkt eller analysere genotype basert på annet cellemateriale.

 

Pasientens genotype er i utgangspunktet stabil og uendret gjennom hele livet. Det er således normalt ikke indisert å gjenta en genotyping hvis den er utført tidligere og svaret er tilgjengelig for rapportering.

Unntak kan være:

  • Ønske om ny genotyping med en mer omfattende metode:
    Hvis man tidligere bare har fått undersøkt én eller noen få DNA-sekvensvarianter i det aktuelle genet, kan det være aktuelt å teste påny med en ny eller mer omfattende metode som fanger opp flere varianter.
  • Pasienten er transplantert:
    Stamcelletransplantasjon tilfører donorleukocytter, noe som vil gi endret genotype ved analysering av blodprøve. Organtransplantasjon tilfører organ med donors genotype. Blodceller og øvrige vev er da uendret.
  • Mistanke om feil:
    Selv om det er sjelden, kan det forekomme berettiget mistanke om feil genotyperesultat. I så fall kan ny genotyping være indisert. I tillegg til prøveforbytning eller feil knyttet til analysering eller rapportering, kan det ved leukopeni i forbindelse med graviditet eller hos personer som får ordinær blodoverføring (én enhet SAG-blod kan inneholde inntil 1 million leukocytter) forekomme at det i en periode på inntil noen måneder blir en tilblanding og proliferasjon av fosters eller blodgivers leukocytter (mikrokimerisme) som kan gi endret genotyperesultat.
  • Klonal ekspansjon av mutert cellelinje hos pasienten

Analysemetode 

Rikshospitalet

Sanntids PCR med alleldeteksjon vha. hybridiseringsprober og smeltekurveanalyse på LightCycler® 480 (Roche) instrument.


Analysen omfatter undersøkelse av følgende APOE-genvarianter (alleler):