Adeno-/rotavirus (feces) PCR

Undersøkelse

Nukleinsyrepåvinsing (PCR). Påviser DNA fra Adeno- og rotavirus.

Adeno- og rotavirus undersøkes alltid som del av en pakke gastroenterittvirus som består av Noro-/sapovirus (feces) PCR, adeno- og rotavirus.

Ved mistanke om tarmpatogene bakterier/parasitter, se Tarmpatogene bakterier/parasitter

For adenovirus i luftveier, se Adenovirus (sekret) PCR

Prøvemateriale

Avføring.

Prøve av oppkast utføres ikke, da denne analysen er lite sensitiv.

Prøvetaking

Bruk Fecal transwab (mørk blå kork) og medfølgende pensel. Penselen kan brukes direkte i avlagt avføring eller føres 1-2 cm inn i pasientens endetarm (ikke forbi rødt merke på penselen). Det skal være synlig, helst rikelig, avføring på penselen. Penselen må brekkes av i knekkpunktet før den festes i korken. Skru korken godt på.

Analysevolum

Beholderen inneholder flytende medium som ikke må helles ut.

Oppbevaring og holdbarhet

Prøven kan med fordel oppbevares kjølig frem til forsendelse.

Holdbar 2 uker.

Feilkilder

Kontaminasjon. Rotavirusanalysen skiller ikke vaksinestamme fra andre stammer.

Analysen utføres ved

Mikrobiologisk avdeling, Sykehuset i Vestfold

Forventet svartid

Utføres daglig (hverdager).

Indikasjon

Gastroenteritt, spesielt hos barn og eldre. Utbrudd i institusjon. Diare hos immunsupprimerte.

Kliniske opplysninger

Symptombeskrivelse og varighet. Vaksinestatus rotavirus og tidspunkt for denne.

Angi evt. immunsvekkelse. Angi evt. mistanke om utbrudd.

Referanseområde

Påvist/Ikke påvist

Resultat og tolkning

Positiv prøve bekrefter tilstedeværelse av virus. En del infeksjoner er asymptomatiske.

Bakgrunn/merknader

Adenovirus tilhører gruppen adenoviridae. Det finnes flere undergrupper av adenovirus, og noen av disse kan gi gastroenteritt. Adenovirus PCR i feces er kun rettet mot virustyper som er assosiert med gastroenteritt (serotype 40 og 41).

Adenovirusgastroenteritt varer typisk ca en uke. Inkubasjonstid ved gastroenteritt er vanligvis 7-10 dager.

Rotavirus tilhører gruppen reoviridae. Hovedsakelig rammer rotavirus små barn, men kan også ses hos voksne, spesielt immunsvekkede.

Rotavirusanalysen skiller ikke vaksinestamme fra andre stammer.