Mikrobiologiske analyser som begynner på ...
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
Æ
Ø
Å
Tarmpatogene bakterier/parasitter
07.09.2023•Versjon 1.4
Labteknisk
Undersøkelse
PCR og/eller dyrkning av tarmpatogene bakterier og parsitter.
Rutinemessig undersøkes prøve med PCR rettet mot bakterier og parasitter:
- Bakterier: Salmonella, Campylobacter, Yersinia, Shigella/enteroinvasiv E. coli (EIEC), enterotoksigen E. coli (ETEC), enteroaggregativ E. coli (EAEC) og enterohemorragisk E. coli (EHEC). Ved spesielle indikasjoner kan prøven også undersøkes for enteropatogen E. coli (EPEC).
- Parasitter: Giardia lamblia, Cryptosporidium og Entamoeba histolytica.
Prøven kan også undersøkes for ved dyrkning av Vibrio cholera, Aeromonas og Plesiomonas, se bakgrunn/merknader.
For undersøkelse på gastroenterittvirus, se Adeno-/rotavirus (feces) PCR og Noro-/sapovirus (feces) PCR. Ved mistanke om antibiotikaassosiert diare, se Clostridioides difficile toksin.
Prøvemateriale
Avføring.
Prøvetaking
Bruk Fecal transwab (mørk blå kork) og medfølgende pensel. Penselen kan brukes direkte i avlagt avføring eller føres 1-2 cm inn i pasientens endetarm (ikke forbi rødt merke på penselen). Det skal være synlig, helst rikelig, avføring på penselen. Penselen må brekkes av i knekkpunktet før den festes i korken. Skru korken godt på.
Analysevolum
Beholderen inneholder flytende medium som ikke må helles ut.
Oppbevaring og holdbarhet
Prøven kan med fordel oppbevares kjølig frem til forsendelse.
Holdbar 2 uker for PCR-undersøkelse, 3 døgn hvis kliniske opplysninger tilsier dyrkning av prøven (se bakgrunn/merknader). Kortest mulig transporttid anbefales.
Feilkilder
Kontaminasjon. Manglende vekst ved dyrkning kan skyldes pågående/nylig antibiotika eller lav bakteriemengde.
Analysen utføres ved
Mikrobiologisk avdeling, Sykehuset i Vestfold
Forventet svartid
PCR-undersøkelse: utføres daglig (hverdager).
Dyrkning: utføres daglig (hverdager)
Svartiden for bakterier kan forlenges ved positiv primærtest. Foreløpige svar tilstrebes i påvente av endelig svar.
Klinisk
Indikasjon
Hovedindikasjon er diaréutredning.
Noen andre distinkte entiteter listes opp her:
- Leverabscess (Entamoeba histolytica).
- Tyfoid/paratyfoidfeber (Salmonella typhi/paratyphi).
- Pseudoappendicitt (Yersinia)
- Hemolytisk uremisk syndrom (EHEC)
- Guillain-Barré syndrom (Campylobacter)
- Dysenteri (Shigella)
Kliniske opplysninger
Symptomer, særlig blodig avføring. Systemisk påvirkning (inkl feber). Opphold i endemisk område/utenlandsreiser, angi konkret reisemål. Immunstatus. Evt antibiotika. Mistanke om HUS. Inntak av sjømat. Oppklaring av utbrudd.
Referanseområde
Påvist/ikke påvist.
Resultat og tolkning
Hvert enkelt funn må alltid relateres til klinikken pasienten presenterer. Generelt vil man være tilbakeholden med bruk av antibiotika hos pasienter med bakteriell årsak til diaré. For nærmere informasjon om indikasjon for behandling av gastroenteritt, se antibiotikaretninglinjene for primærhelsetjenesten og sykehus. For informasjon om smitteverntiltak, se Folkehelseinstituttets smittevernveileder.
Bakgrunn/merknader
Det utføres rutinemessig PCR på Salmonella, Shigella, Yersinia, Campylobacter, enteroinvasiv E. coli (EIEC), enterotoksigen E. coli (ETEC), enteroaggregativ E. coli (EAEC), enterohemorragisk E. coli (EHEC), Giardia lamblia, Cryptosporidium, Entamoeba histolytica.
Ved kliniske opplysninger om hemolytisk-uremisk syndrom (HUS), smitteoppsporing rundt EHEC/HUS-tilfeller og hos barn < 5 år vil prøven også bli undersøkt for enteropatogen E. coli (EPEC) samt for enterohemorragisk E. coli som har tapt shigatoksingener (EHEC-LST).
Ved mistanke om sjømatforgiftning vil det vurderes dyrkning med tanke på Vibrio, Plesiomonas og Aeromonas.
Ved opplysninger om langvarig risvannliknende diaré og reise/opphold i endemiske områder er det aktuelt å sette opp spesifikk dyrkning av Vibrio cholerae.
Ved funn av tarmpatogene bakterier (unntatt EAEC og ETEC) ved hjelp av PCR vil prøven dyrkes i etterkant for nærmere identifikasjon, og evt. resistensbestemmelse. På grunn av kort overlevelse av Shigella vil det bli bedt om ny prøve ved positiv PCR for Shigella/EIEC (PCR klarer ikke skille mellom Shigella og EIEC).
- Gå til avsnitt
- Labteknisk
- Klinisk
Lukk
