Feces multipleks PCR
Indikasjon
Laboratoriet benytter multipleks real-time PCR for påvisning av:
Bakterier*
- Campylobacter spp.
- EHEC, ETEC
- Salmonella spp.
- Shigella spp./EIEC
- Yersinia enterocolitica
- Plesiomonas shigelloides
- Vibrio spp.
Parastitter
- Cryptosporidium spp
- Entamoeba histolytica
- Giardia lamblia
Virus
- Astrovirus
- Adenovirus
- Norovirus GI/GII
- Rotavirus
- Sapovirus
*Positive funn av enkelte bakterier vil bli dyrket for typing og eventuell resistensbestemmelse.
Prøvemateriale
Feces på Sterilt glass uten tilsetning (med skje) kan benyttes til alle agens.
Feces på ∑ Fecal Transwab kan kun benyttes til tarmpatogene bakterier.
Prøvehåndtering og forsendelse
Sendes i transporthylse av hardplast på grunn av smittefare. Prøven skal oppbevares i kjøleskap og undersøkes innen 3 døgn etter prøvetakning.
Undersøkelsesprinsipp
Real time PCR.
Utførende laboratorium
Avd. for medisinsk mikrobiologi, Kristiansand
Svar
Påvist/Ikke påvist.
Enkelte PCR positive-prøver for bakterielle agens vil bli forsøkt dyrket.
Svartid
Analysen utføres hverdager. Forventet svartid er 1-3 dager for negative prøver.
Tarmpatogene bakterier PCR med funn: Et foreløpig svar fra PCR vil ha svartid på 1-3 dager, mens det endelige dyrkningssvaret kommer 2-4 døgn etter PCR svar.
Merknader
Opplysning om smittested er viktig med tanke på å oppdage innenlands matbårne utbrudd så tidlig som mulig.
Akkreditert
PCR og dyrkning av kontrollprøver er akkreditert, med unntak av følgende agens: Vibrio cholera, parahaemolyticus og vulnificus, Plesiomonas shigelloides og ETEC.
