Mykobakterier omfatter arter i M. tuberculosis-komplekset og non-tuberkuløse mykobacterier (NTM). NTM er miljømikrober, men kan gi sykdom spesielt hos kronisk lungesyke eller immunsupprimerte. Ellers friske personer kan også få infeksjoner med NTM: lymfadenitt (barn), sårinfeksjon og sykehusassosierte infeksjoner.

NTM deles inn i hurtigvoksende og langsomtvoksende.

FHI har referansefunksjon for alle mykobakterier som har gir sykdom hos mennesker, og utfører analyser for identifikasjon og resistenspåvisning av klinsike isolater.

Resistenstesting er aktuelt når isolatet antas å ha klinisk betydning og det er aktuelt å behandle pasienten. Isolat fra luftveismateriale kan representere forurensing eller en forbigående kolonisering og skal ikke automatisk resistenstestes. Det bør som en hovedregel, foreligge minst to ekspektoratprøver med tilsvarende funn eller en BAL (bronchoalveolar lavage). Viser til retningslinjer (2, 3) for nærmere beskrivelse av diagnostiske kriterier.

• PASIENTRETTET:
  • Identifisere NTM art som er årsak til infeksjon/sykdom
  • Resistenstesting for å kunne gi riktig behandling
• FOLKEHELSERETTET:
  • Oversikt over funn av NTM arter
  • Bidra til kartlegging av helsetjeneste assosierte infeksjoner med NTM
  • Oversikt over antibiotikaresistens hos NTM

Påvist NTM eller infeksjon er ikke nominativt meldepliktig, men inngår i referansefunksjonen.

Vi mottar kulturer/isolat på flytende eller fast medium.

• Mikrobiologiske rekvisisjoner FHI: Skjemaer - samleside
• Innsending av prøver til mikrobiologiske undersøkelser
• Praktisk veiledning: prøvemengde, medium, kjøling og pakking

Vi utfører identifikasjon og resistenstesting ved behov, dvs hvis mottatt isolatet ikke er identifisert ved innsendende lab. og hvis funnet er klinisk relevant og behandling er aktuelt. Viser til referanser for indikasjon for behandling og aktuelt antibiotika regime.

Følgende analyser blir utført på mottatte kulturer:

• LPA (line probe assay, Hain), primært GenoType Mycobacterium CM (commen) ev. supplert med Mycobacterium AS og/eller NTM-DR
  • CM og AS baserer seg på 23S genet, og identifiserer en rekke arter/grupper, men med noe varierende spesifisitet
  • GenoType NTM-DR når behov for
    • nærmere identifikasjon av M. intracellulare-gruppen og subspecies i M. abscessus-komplekset
    • rask foreløpig avklaring av resistens for makrolider og aminoglykosider
• Fenotypisk resistensbestemmelse utføres med buljongmikrofortynning iht CLSI standard, både av hurtig- og langsomtvoksende mykobakterier, med noen tilpasninger for de langsomtvoksende.
• NGS utføres ved behov hvis LPA ikke gir god nok indentifikasjon

Vi mottar kulturer/isolat til stammebank.

Det sendes fortløpende ut skriftlig svar på analyser nevnt over og ved behov, blir resultatene ringt ut til innsendende lab., ev. behandlende lege.

Resultat på LPA vil stort sett foreligge iløpet av en uke etter at kulturen er mottatt, men det kan ta lengre tid hvis det er behov for supplerende testing.

Resultat på fenotypisk resistensbestemmelse vil kunne foreligge etter 2-4 uker, avhengig av om bakterien er hurtig- eller langsomtvoksende.

LPA, NTM-DR, rapporteres med PÅVIST/IKKE PÅVIST for mutasjoner i gener som er inkludert i testen:

• rrl genet predikerer ervervet makrolid resistens
• rrs genet predikerer resistens for aminoglykosider
• erm (41) genet predikerer induserbar resistens for makrolider for subspecies i M. abcessus-komplekset

Resultat på fenotypisk resistensbestemmelse rapporteres med MIC og SIR kategori iht CLSI standard, men med noen modifikasjoner for langsomtvoksende NTM. For mange arter og antibiotika er det ikke etablert SIR kategori, siden det ikke er påvist sikker sammenheng mellom MIC verdi og klinisk respons.

Medisinsk faglig ansvarlig

• Anne Torunn Mengshoel

Faglig ansvarlig

• Anne Torunn Mengshoel (fenotypi, LPA)
• Vegard Eldholm (helgenomsekvensering, slektskapsanalyser)

• Omtale av infeksjon med NTM i Smittevernveilederen