Molekylære analyser, solide svulster
MGMT-metylering
Prøvemateriale
Formalinfiksert, parafininnstøpt (FFPE) vev.
Forventet svartid
Forventet svartid er innen 15 virkedager.
Undersøkelsesprinsipp
Metyleringsfrekvensen i MGMT CpG-island påvises ved hjelp av EpiDirect® MGMT Methylation qPCR Assay fra PentaBase. Det er et semi-automatisk real-time Polymerase Chain Reaction (PCR) assay som er tiltenkt for en direkte semi-kvantitativ analyse av metyleringsstatus av genet for DNA reparasjonsprotein O6-methylguanine-DNA methyltransferase (MGMT).
Svar
Angitt resultat oppgis i prosent metylert ut fra 4 CpG-områder (CpG 75-78) i MGMT.
Grenseverdi for metylert/ikke metylert er satt til 3%.
Tolkning
Testen detekterer metylering av 4 CpG-områder (CpG 75-78) i region 2 (DMR2, hg38 chr10; 129,467,232-129,467,36) i MGMT.
Måleusikkerhet
For utregning av metyleringsporsent for MGMT har vi nå på lab innført bruk av standardkurve etter anbefaling av leverandør (PentaBase).
Dette fører til en endring i gråsoneintervallet fra [1,5 – 4%] til [2,5 - 5%] metylert.
Grenseverdi for metylert/umetylert er fortsatt 3%, men da med gråsone [2,5 - 5%].
Nyttige lenker
Vi kan ikke love deg svar på tilbakemeldingen din, men bruker den til å forbedre innholdet. Vi ber om at du ikke deler person- eller helseopplysninger.
