Hemavision 28Q, screening fusjonstranskript

Sist oppdatert: 24.05.2024
Forfattere: Ingvild Vorkinn, Nimo Hatinoor og Helen Vålerhaugen
Utgiver: Oslo universitetssykehus
Godkjent av: Mohsen Shadidi
Godkjent dato: 13.05.2024
Versjon: 1.3
For tilgang til tidligere versjoner, kontakt redaktøren.
Kopier lenke til dette emnet
Foreslå endringer/gi kommentarer

Viktig informasjon 

  • Prøven bør ankomme laboratoriet innen 24 timer
  • Prøver tatt fredager og dag før helligdag må sendes med bud/taxi og ankomme senest 13.30

Indikasjon 

  • Screening av fusjonstranskripter ved ALL og AML
    • Ved dårlig prøvekvalitet eller < 20 % blaster vil målrettede enkeltanalyser benyttes, se Hematopatologi, AML og Hematopatologi, ALL
  • Analysen kan benyttes som tilleggsanalyse ved negativ screening for KML og mistanke om sjeldent BCR::ABL1-transkript

Prøvemateriale 

Prøvetaking og prøvebehandling 

Oppbevaring og forsendelse 

Utførende laboratorium 

  • Enhet for molekylær hematopatologi, OUS Radiumhospitalet

Forventet svartid 

  • 1 - 3 virkedager

Undersøkelsesprinsipp 

  • Hemavision 28Q (DNA Diagnostic) detekterer 28 fusjonstranskript funnet i ALL, AML og KML
  • Utføres i RNA med multiplex Real-time PCR (RT-qPCR)
  • Inkluderer BCR::ABL1 (M-, m- og µ-bcr), CBFB::MYH11, DEK::NUP214, ETV6::ABL1, ETV6::MN1, ETV6::PDGFRB, ETV6::RUNX1, FUS::ERG, KMT2A::AFDN, KMT2A::AFF1, KMT2A::ELL, KMT2A::EPS15, KMT2A::FOXO4, KMT2A::MLLT1, KMT2A::MLLT3, KMT2A::MLLT6, KMT2A::MLLT10, KMT2A::MLLT11, NPM1::MLF1, NPM::RARA, PML::RARA (bcr1, bcr2 og bcr3), RUNX1::MECOM, RUNX1::RUNX1T1, SET::NUP214, STIL::TAL1, TCF3::HLF, TCF3::PBX1 og ZBTB16::RARA

Svar 

  • Påvist/ikke påvist

Tolkning 

  • Metoden kan ikke identifisere nøyaktig bruddpunkt til et påvist fusjonsgen
  • Falsk negativ resultat grunnet sjeldne fusjoner kan forekomme. Ved behov for utvidet screening med dypsekvensering, se FusionPlex Pan Heme
  • For enkelte fusjonsgen må tilleggsanalyser utføres for å avgjøre om laboratoriet kan tilby oppfølgingsanalyse med MRD, Se Hematopatologi, oppfølging (MRD) for hvilke analyser som er etablert
  • Fusjonstranskript hvor vi ikke har etablert analyse for MRD-oppfølging vil kommenteres

Måleusikkerhet 

  • Det er kun de hyppigste fusjonene innenfor hvert fusjonsgen som detekteres, falsk negativt resultat kan ikke utelukkes ved sjeldne varianter av et fusjonsgen
  • Nedre deteksjonsgrense varierer for hvert fusjonsgen

Fant du det du lette etter?
Ja
Nei
Så bra. Fortell oss gjerne hva du var fornøyd med.
Vi kan ikke love deg svar på tilbakemeldingen din, men bruker den til å forbedre innholdet. Vi ber om at du ikke deler person- eller helseopplysninger.
Send
Kan du fortelle oss hva du var ute etter?
Vi kan ikke love deg svar deg på tilbakemeldingen din, men bruker den til å forbedre innholdet. Vi ber om at du ikke deler person- eller helseopplysninger.
Send