Enhet for molekylær hematopatologi, OUS Radiumhospitalet
Forventet svartid
3 uker
Ved hehov kan analysen utføres som CITO, kontakt laboratoriet
Undersøkelsesprinsipp
Kvantitering av transkript av RNA med analyser rettet mot 5'ende (som koder for N-terminal del av proteinet) og 3'ende (C-terminal) av PDGFRA eller PDGFRB med Real-time PCR (RT-qPCR)
3'ende genuttrykk normaliseres med referansegenet ABL1
3'ende genuttrykk normaliseres med 5'ende genuttrykk (3'/5'ende ratio)
Svar
Påvist økning av PDGFRA- eller PDGFRB-transkripter, som indikerer en rearrangering av genet
Ikke påvist økning av PDGFRA- eller PDGFRB-transkripter
Påvist lett økning av PDGFRA- eller PDGFRB-transkripter, uten sikre holdepunkter for translokasjon av genet
Tolkning
Forhøyet 3'ende uttrykk normalisert med referansegen og med økt 3'/5'ende ratio indikerer at det foreligger en rearrangering
Forhøyet 3'ende normalisert med referansegen, uten samtidig økt 3'/5'ende ratio vil ha usikker årsak, laboratoriet utfører tileggsanalyser
Lett forhøyet 3'ende PDGFRA/PDGFRB normalisert med referansegen, uten samtidig økt 3'/5'ende ratio tyder ikke på en rearrangering. I slike tilfeller bør det vurderes om man bør kontrollere funn i en ny prøve eller utføre tilleggsanalyser
Måleusikkerhet
I prøver med uttalt eosinofili kan det være utfordrende å få akseptabel RNA kvalitet for sikker tolkning. Da vil ny prøve anbefales
Ved vedvarende dålig kvalitet grunnet eosinofili må forsendelse avtales med laboratoriet i forkant, slik at laboratoriet kan preparere den umiddelbart. Prøven må sendes med bud/taxi og ankomme så fort som mulig
Referanseområdet er basert på friske voksne givere. Lett økning av 3'/ABL1 uten indikasjon på rearrangering kan f.eks skyldes unormal cellefordelig. Kontrollanalyse bør vuderes
Så bra. Fortell oss gjerne hva du var fornøyd med. Vi kan ikke svare deg på tilbakemeldingen din, men bruker den til å forbedre innholdet. Vi ber om at du ikke deler person- eller helseopplysninger.
Kan du fortelle oss hva du var ute etter? Vi kan ikke svare deg på tilbakemeldingen din, men bruker den til å forbedre innholdet. Vi ber om at du ikke deler person- eller helseopplysninger.