Analyser som begynner på ...
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
Æ
Ø
Å

PDGFRA og PDGFRB rearrangering

Sist oppdatert: 19.11.2024
Forfatter: Helen Vålerhaugen
Utgiver: Oslo universitetssykehus
Versjon: 1.1
For tilgang til tidligere versjoner, kontakt redaktøren.
Kopier lenke til dette emnet
Foreslå endringer/gi kommentarer

Viktig informasjon 

  • Prøven bør ankomme laboratoriet innen 24 timer
  • Prøver tatt fredager og dag før helligdag må sendes med bud/taxi og ankomme senest 13.30

Indikasjon 

  • Ved mistanke om myeloid/lymfoid neoplasi med rearrangering av PDGFRA eller PDGFRB
  • Rearrangering er fobundet med eosinofili, unntak kan forekomme

Prøvemateriale 

Oppbevaring og forsendelse 

Utførende laboratorium 

  • Enhet for molekylær hematopatologi, OUS Radiumhospitalet

Forventet svartid 

  • 3 uker
  • Ved hehov kan analysen utføres som CITO, kontakt laboratoriet

Undersøkelsesprinsipp 

  • Kvantitering av transkript av RNA med analyser rettet mot 5'ende (som koder for N-terminal del av proteinet) og 3'ende (C-terminal) av PDGFRA eller PDGFRB med Real-time PCR (RT-qPCR)
    • 3'ende genuttrykk normaliseres med referansegenet ABL1
    • 3'ende genuttrykk normaliseres med 5'ende genuttrykk (3'/5'ende ratio)

Svar 

  • Påvist økning av PDGFRA- eller PDGFRB-transkripter, som indikerer en rearrangering av genet
  • Ikke påvist økning av PDGFRA- eller PDGFRB-transkripter
  • Påvist lett økning av PDGFRA- eller PDGFRB-transkripter, uten sikre holdepunkter for translokasjon av genet

Tolkning 

  • Forhøyet 3'ende uttrykk normalisert med referansegen og med økt 3'/5'ende ratio indikerer at det foreligger en rearrangering
  • Forhøyet 3'ende normalisert med referansegen, uten samtidig økt 3'/5'ende ratio vil ha usikker årsak, laboratoriet utfører tileggsanalyser
  • Lett forhøyet 3'ende PDGFRA/PDGFRB normalisert med referansegen, uten samtidig økt 3'/5'ende ratio tyder ikke på en rearrangering. I slike tilfeller bør det vurderes om man bør kontrollere funn i en ny prøve eller utføre tilleggsanalyser

Måleusikkerhet 

  • I prøver med uttalt eosinofili kan det være utfordrende å få akseptabel RNA kvalitet for sikker tolkning. Da vil ny prøve anbefales
  • Ved vedvarende dålig kvalitet grunnet eosinofili må forsendelse avtales med laboratoriet i forkant, slik at laboratoriet kan preparere den umiddelbart. Prøven må sendes med bud/taxi og ankomme så fort som mulig
  • Referanseområdet er basert på friske voksne givere. Lett økning av 3'/ABL1 uten indikasjon på rearrangering kan f.eks skyldes unormal cellefordelig. Kontrollanalyse bør vuderes

Fant du det du lette etter?
Ja
Nei
Så bra. Fortell oss gjerne hva du var fornøyd med.
Vi kan ikke svare deg på tilbakemeldingen din, men bruker den til å forbedre innholdet. Vi ber om at du ikke deler person- eller helseopplysninger.
Send
Kan du fortelle oss hva du var ute etter?
Vi kan ikke svare deg på tilbakemeldingen din, men bruker den til å forbedre innholdet. Vi ber om at du ikke deler person- eller helseopplysninger.
Send