Ved mistanke om infeksiøs diare/gastroenteritt benyttes syndrom-PCR for påvisning av et bredt panel av tarmpatogene bakterier, virus og parasitter. Ved funn av tarmpatogene bakterier vil prøven også kunne bli dyrket for typing og eventuell resistensbestemmelse.
Laboratoriet vil basert på kliniske opplysninger i enkelte tilfelle gjøre dyrkning i tillegg til PCR-analyse. Det er derfor viktig at det oppgis relevante kliniske opplysninger, se Dyrkning av fæcesprøver.
Bakterier | |
---|---|
Salmonella spp. | Campylobacter spp. |
Yersinia enterocolitica | Shigella spp./EIEC |
Clostrioides difficile toksin B | Aeromonas spp.* |
Vibrio spp. | Plesiomonas spp.** |
EHEC (Enterohemoragisk E. coli) | ETEC (Enterotoksigen E. coli) |
EPEC (Enteropatogen E. coli) | EAEC (Enteroaggregativ E. coli) |
Virus | |
Norovirus | Rotavirus |
Adenovirus (genotype F) | Astrovirus |
Sapovirus | |
Parasitter | |
Cryptosporidium spp | Giardia lamblia |
Entamoeba histolytica |
|
*prøver fra polikliniske pasienter
**prøver fra innlagte pasienter
Kvalitativ påvisning av de beskrevne gastroenteritt-agens ved hjelp av sanntids polymerasereaksjon (multipleks PCR).
Avdeling for Medisinsk mikrobiologi, St. Olavs Hospital
Påvist/Ikke påvist/Inkonklusiv/Se kommentar (med tekst) for hvert agens.
Følgende tilstander er nominativt meldipliktige til MSIS (Gruppe A)
Se også MSIS meldepliktige sykdommer for komplett oversikt.
Opplysning om smittested er viktig med tanke på å oppdage innenlands matbårne utbrudd så tidlig som mulig.
Alle PCR-funn av tarmpatogene bakterier (unntatt ETEC, EAEC, EPEC, C. difficile, og Camylobacter sp. fra polikliniske pasienter) vil bli forsøkt dyrket.
PCR-funn av rotavirus vil bli undersøkt videre for skille mellom vaksinestamme og villtypevirus.
Ved spesielle kliniske problemstillinger vil det også i bli gjort dyrkning parallelt med PCR-analysen. Det er derfor avgjørende at gode kliniske opplysninger er angitt!
Indikasjon for dyrkning i tillegg til PCR
Analysen er akkreditert etter ISO 15189.